RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 TTC8Q8TAM2 541 aa7.03□□□□□ -1.28
CCL20-201ENST00000358813 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.03□□□□□ -1.28
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CCL20-201ENST00000358813 CDH19Q9H159 772 aa7.03□□□□□ -1.28
CCL20-201ENST00000358813 SLC52A2Q9HAB3 445 aa7.03□□□□□ -1.28
CCL20-201ENST00000358813 WHRNQ9P202 907 aa7.03□□□□□ -1.28
CCL20-201ENST00000358813 KNDC1Q76NI1 1749 aa7.03□□□□□ -1.28
CCL20-201ENST00000358813 IFT172Q9UG01 1749 aa7.03□□□□□ -1.28
CCL20-201ENST00000358813 KIAA0232Q92628 1395 aa7.03□□□□□ -1.28
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CCL20-201ENST00000358813 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
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CCL20-201ENST00000358813 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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CCL20-201ENST00000358813 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
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CCL20-201ENST00000358813 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCL20-201ENST00000358813 SYCP2LQ5T4T6 812 aa6.99□□□□□ -1.29
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