RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336070.11

FRMD1-202, Transcript of FERM domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene FRMD1, Length 1,600 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD1-202ENST00000336070 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.56■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 GJA10Q969M2 543 aa20.56■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.56■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 MAGEF1Q9HAY2 307 aa20.56■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 NFASCO94856 1347 aa20.55■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 A0A087X0B3 334 aa20.55■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 PP2D1A8MPX8 630 aa20.55■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 RPA1P27694 616 aa20.55■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 STAT6P42226 847 aa20.55■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 ZNF445P59923 1031 aa20.55■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 CAMK4Q16566 473 aa20.55■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 MORN1Q5T089 497 aa20.55■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 DHX58Q96C10 678 aa20.55■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 STK17AQ9UEE5 414 aa20.55■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.55■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 HOXC6P09630 235 aa20.54■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 VEGFBP49765 207 aa20.54■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 KRT76Q01546 638 aa20.54■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 EPHA7Q15375 998 aa20.54■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 RDM1Q8NG50 284 aa20.54■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 NEK9Q8TD19 979 aa20.54■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 SOCS4Q8WXH5 440 aa20.54■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 SERTAD1Q9UHV2 236 aa20.54■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 MYL1P05976 194 aa20.53■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 SFNP31947 248 aa20.53■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 MAP2K5Q13163 448 aa20.53■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 IRF5Q13568 498 aa20.53■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.53■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.53■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.53■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 ATP9AO75110 1047 aa20.53■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 SEMA3FQ13275 785 aa20.53■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.53■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.53■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 KIAA1468Q9P260 1216 aa20.53■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 SYCE3A1L190 88 aa20.52■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 KCNA2P16389 499 aa20.52■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 JAK3P52333 1124 aa20.52■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 AMPD3Q01432 767 aa20.52■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 GRB10Q13322 594 aa20.52■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 NEDD9Q14511 834 aa20.52■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 PDXDC2PQ6P474 469 aa20.52■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 ARMCX2Q7L311 632 aa20.52■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 USP6NLQ92738 828 aa20.52■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 MAML3Q96JK9 1138 aa20.52■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.52■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 UNC45AQ9H3U1 944 aa20.52■□□□□ 0.88
FRMD1-202ENST00000336070 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.51■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 PLCG1P19174 1290 aa20.51■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 FCGRTP55899 365 aa20.51■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.51■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.51■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.51■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.51■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 PAGE5Q96GU1 130 aa20.51■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 UIMC1Q96RL1 719 aa20.51■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 VTA1Q9NP79 307 aa20.51■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.51■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 EML1O00423 815 aa20.5■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 POSTNQ15063 836 aa20.5■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.5■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 MIER3Q7Z3K6 550 aa20.5■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 PNMA5Q96PV4 448 aa20.5■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 TINF2Q9BSI4 451 aa20.5■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 GJD2Q9UKL4 321 aa20.5■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 WDR64B1ANS9 1081 aa20.49■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 SLITRK3O94933 977 aa20.49■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 P4HBP07237 508 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa20.49■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 CCDC192P0DO97 292 aa20.49■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 RGS2P41220 211 aa20.49■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 KIF22Q14807 665 aa20.49■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.49■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 SCFD2Q8WU76 684 aa20.49■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.49■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 RNF186Q9NXI6 227 aa20.49■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 SLC9A2Q9UBY0 812 aa20.49■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 SP3Q02447 781 aa20.49■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.49■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 SV2BQ7L1I2 683 aa20.49■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 CKAP2LQ8IYA6 745 aa20.49■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 SPATA20Q8TB22 786 aa20.49■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20.49■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 TUBE1Q9UJT0 475 aa20.49■□□□□ 0.87
FRMD1-202ENST00000336070 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms