RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296051.6

HPS3-201, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS3, Length 4,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-201ENST00000296051 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HPS3-201ENST00000296051 KAZALD1Q96I82 304 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS3-201ENST00000296051 LRRC1Q9BTT6 524 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS3-201ENST00000296051 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HPS3-201ENST00000296051 PNMA2Q9UL42 364 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS3-201ENST00000296051 SHROOM2Q13796 1616 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS3-201ENST00000296051 GRIN3BO60391 1043 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS3-201ENST00000296051 ZNF131P52739 623 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS3-201ENST00000296051 ANTXR2P58335 489 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS3-201ENST00000296051 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS3-201ENST00000296051 GJA10Q969M2 543 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS3-201ENST00000296051 H2AFZP0C0S5 128 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 PPP2R5AQ15172 486 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 H2AFVQ71UI9 128 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 HPS3Q969F9 1004 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 STAT2P52630 851 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 MTMR3Q13615 1198 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 NEK8Q86SG6 692 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 CCDC63Q8NA47 563 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 LCMT1Q9UIC8 334 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 ATG9AQ7Z3C6 839 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 NDST4Q9H3R1 872 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 NRBP2Q9NSY0 501 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 CCNE1P24864 410 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 SESN3P58005 492 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 SARNPP82979 210 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 PNMA3Q9UL41 463 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 STAT1P42224 750 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 CYP2J2P51589 502 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 YARSP54577 528 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 NUB1Q9Y5A7 615 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 NCAPHQ15003 741 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 CEP152O94986 1710 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 STX2P32856 288 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 KCNJ6P48051 423 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 NR1I3Q14994 352 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 C6orf163Q5TEZ5 329 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 TEKT3Q9BXF9 490 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 A0A1B0GTH6 734 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 KRT14P02533 472 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 SNAP25P60880 206 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 FOXR1Q6PIV2 292 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 COA7Q96BR5 231 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 TRIM7Q9C029 511 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 SLC24A3Q9HC58 644 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 PANK4Q9NVE7 773 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 PLAAQ9Y263 795 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 USTQ9Y2C2 406 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 LGALS16A8MUM7 142 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 GYPCP04921 128 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 ZNF365Q70YC5 407 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 AKT3Q9Y243 479 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 KRT15P19012 456 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 LIG4P49917 911 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 DISC1Q9NRI5 854 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 CALUO43852 315 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 ALKQ9UM73 1620 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 DAPK3O43293 454 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 ALDH3A1P30838 453 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 MS4A14Q96JA4 679 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 EHD2Q9NZN4 543 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 NEDD9Q14511 834 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 MAN2A1Q16706 1144 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 UBL4BQ8N7F7 174 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 CCDC127Q96BQ5 260 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 TSNARE1Q96NA8 513 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 RAB17Q9H0T7 212 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 PALMO75781 387 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS3-201ENST00000296051 CDK8P49336 464 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms