RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 DENND2CQ68D51 928 aa16.74■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 MAEAQ7L5Y9 396 aa16.74■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 CCDC65Q8IXS2 484 aa16.74■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 CCDC197Q8NCU1 140 aa16.74■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 PIGSQ96S52 555 aa16.74■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa16.74■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 SART1O43290 800 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 BAG3O95817 575 aa16.74■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 ACTN1P12814 892 aa16.74■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP16.74■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 CALRP27797 417 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 LMBR1Q8WVP7 490 aa16.74■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 SWAP70Q9UH65 585 aa16.74■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 LDHBP07195 334 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 KCNB1Q14721 858 aa16.73■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 GPBP1Q86WP2 473 aa16.73■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 PCDHA6Q9UN73 950 aa16.73■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 KIAA1024Q9UPX6 916 aa16.73■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa16.73■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 A0A087X0T9 212 aa16.73■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 FLOT1O75955 427 aa16.73■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 FAM107AO95990 144 aa16.73■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 FGGP02679 453 aa16.73■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 SERPING1P05155 500 aa16.73■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 FAM228BP0C875 321 aa16.73■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 LRRC14Q15048 493 aa16.73■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 BTG4Q9NY30 223 aa16.73■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 TTI1O43156 1089 aa16.73■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 NR2F2P24468 414 aa16.73■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 PPP2R2AP63151 447 aa16.73■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 PDXDC1Q6P996 788 aa16.73■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 ZNF507Q8TCN5 953 aa16.73■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 TRIM51Q9BSJ1 452 aa16.73■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 SALL4Q9UJQ4 1053 aa16.73■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 ZNF652Q9Y2D9 606 aa16.73■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 SNX24Q9Y343 169 aa16.73■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 CDC25CP30307 473 aa16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 HSD17B3P37058 310 aa16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 MTMR3Q13615 1198 aa16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 KCNV1Q6PIU1 500 aa16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 SHISA4Q96DD7 197 aa16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 SEC16BQ96JE7 1060 aa16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 SEMA6BQ9H3T3 888 aa16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 ZNF287Q9HBT7 754 aa16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 PNMA2Q9UL42 364 aa16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 RGPD5Q99666 1765 aa16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 MYMKA6NI61 221 aa16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 CLIC2O15247 247 aa16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 MMEP08473 750 aa16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 H2AFZP0C0S5 128 aa16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 UBE2SQ16763 222 aa16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 LRCH2Q5VUJ6 765 aa16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 CYB5D1Q6P9G0 228 aa16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 H2AFVQ71UI9 128 aa16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 GLIS3Q8NEA6 775 aa16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 MEIS1O00470 390 aa16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 TDP2O95551 362 aa16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 NAALADL2Q58DX5 795 aa16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 AMFRQ9UKV5 643 aa16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa16.72■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 OPLAHO14841 1288 aa16.71■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 GFPT2O94808 682 aa16.71■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 HOOK3Q86VS8 718 aa16.71■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 FMO2Q99518 471 aa16.71■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 CARD10Q9BWT7 1032 aa16.71■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 LRRC27Q9C0I9 530 aa16.71■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 SERPINA10Q9UK55 444 aa16.71■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 TBCAO75347 108 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP16.71■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 CYP4A11Q02928 519 aa16.71■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 KDM7AQ6ZMT4 941 aa16.71■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 PCDHA12Q9UN75 941 aa16.71■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 MEA1Q16626 185 aa16.71■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 CAPN12Q6ZSI9 719 aa16.71■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 CCDC50Q8IVM0 306 aa16.71■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 EYA3Q99504 573 aa16.71■□□□□ 0.27
USP25-201ENST00000285679 CCDC105Q8IYK2 499 aa16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 FAM167BQ9BTA0 163 aa16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 KDM3BQ7LBC6 1761 aa16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 SLC8A1P32418 973 aa16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
USP25-201ENST00000285679 KCNV2Q8TDN2 545 aa16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms