RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 COG2Q14746 738 aa9.6□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 MEA1Q16626 185 aa9.6□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 FAM153CQ494X1 144 aa9.6□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 ARSHQ5FYA8 562 aa9.6□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 FAM26FQ5R3K3 315 aa9.6□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 UNC13DQ70J99 1090 aa9.6□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.6□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 KLHL7Q8IXQ5 586 aa9.6□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 BAP1Q92560 729 aa9.6□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 SELENOOQ9BVL4 669 aa9.6□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 FAM153AQ9UHL3 310 aa9.6□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 A0A1W2PQC6 194 aa9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 BICDL2A1A5D9 508 aa9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 FAM86B1E9PN63 330 aa9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 TOM1O60784 492 aa9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 FAM86B2P0C5J1 330 aa9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 ATP2B4P23634 1241 aa9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 KLRC1P26715 233 aa9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 PDE4CQ08493 712 aa9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 CCDC174Q6PII3 467 aa9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 MYOCDQ8IZQ8 938 aa9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 PALMO75781 387 aa9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 COPB2P35606 906 aa9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 PRPHP41219 470 aa9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 ATP1A2P50993 1020 aa9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 VAV2P52735 878 aa9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 KRT83P78385 493 aa9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 AMPD3Q01432 767 aa9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 GABPAQ06546 454 aa9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 TRIM14Q14142 442 aa9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 SCFD1Q8WVM8 642 aa9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 BTAF1O14981 1849 aa9.59□□□□□ -0.87
GINS1-201ENST00000262460 SBF2Q86WG5 1849 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 ERLIN1O75477 346 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 ADAM9Q13443 819 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 HSP90B2PQ58FF3 399 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 FAM83BQ5T0W9 1011 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 NAA35Q5VZE5 725 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 SFR1Q86XK3 245 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 CUL5Q93034 780 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 OSBPL9Q96SU4 736 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 CENPHQ9H3R5 247 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 ZNF287Q9HBT7 754 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 HPCAL4Q9UM19 191 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 ROBO3Q96MS0 1386 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 LAMB1P07942 1786 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 DNAH12Q6ZR08 3092 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 TISP43B9A030 160 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 EML1O00423 815 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 SORBS3O60504 671 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 CCDC181Q5TID7 509 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 HGSNATQ68CP4 663 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 SLFN13Q68D06 897 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 MIGA2Q7L4E1 593 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 CATSPER3Q86XQ3 398 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 SIAH1Q8IUQ4 282 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 AP1M1Q9BXS5 423 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 BHMT2Q9H2M3 363 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 SH2D4AQ9H788 454 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 PLAGL2Q9UPG8 496 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 AFF2P51816 1311 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 NRAPQ86VF7 1730 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 TMEM150BA6NC51 233 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 TCP10L2B9ZVM9 353 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 AGPSO00116 658 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 BACH1O14867 736 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 GH2P01242 217 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 KRT14P02533 472 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 GLI1P08151 1106 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 CRKP46108 304 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 MAN2A1Q16706 1144 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 CRY2Q49AN0 593 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 SPATA4Q8NEY3 305 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 ARL8AQ96BM9 186 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 AK8Q96MA6 479 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 TLR10Q9BXR5 811 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 SNX12Q9UMY4 172 aa9.58□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 DLEC1Q9Y238 1755 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 A0A1W2PRG0 241 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 ZBTB5O15062 677 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 CFBP00751 764 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 MMP10P09238 476 aa9.57□□□□□ -0.88
GINS1-201ENST00000262460 CYP11B2P19099 503 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms