RNA–Protein interactions for RNA: YGL246C

RAI1, Transcript of Nuclear protein with decapping endonuclease activity, yeast

Gene RAI1, Length 1,164 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAI1	YGL246C	TUL1	P36096	758 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	THI2	P38141	450 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	CTF3	Q12748	733 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	NUP170	P38181	1502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	DRS2	P39524	1355 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	CLC1	P17891	233 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	CLB3	P24870	427 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	NFU1	P32860	256 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	FRE2	P36033	711 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	KRE9	P39005	276 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	BNI1	P41832	1953 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	IRC20	Q06554	1556 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	BUD3	P25558	1636 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	AGA1	P32323	725 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	REC114	P32841	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	RGT1	P32862	1170 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	RSM22	P36056	628 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	IDP2	P41939	412 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	VTC2	P43585	828 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	YJL132W	P47014	750 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	GDB1	Q06625	1536 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAI1	YGL246C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	CPR3	P25719	182 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	SAS3	P34218	831 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	ARK1	P53974	638 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	DOP1	Q03921	1698 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	PPH22	P23595	377 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	HCS1	P34243	683 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	YBP1	P38315	674 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	YHR218W	P38899	603 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	GCD10	P41814	478 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	SPC19	Q03954	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	NDI1	P32340	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	FMS1	P50264	508 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	YMR155W	Q03795	547 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	CAT8	P39113	1433 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	TRM3	Q07527	1436 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	YBT1	P32386	1661 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	YIM1	P28625	365 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	RML2	P32611	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	NIP100	P33420	868 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	TRS85	P46944	698 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	AVT4	P50944	713 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	PNG1	Q02890	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	IQG1	Q12280	1495 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	RIP1	P08067	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	PMR1	P13586	950 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	YCR100C	P25606	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	BYE1	P36106	594 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	RRT5	P43607	289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	CAF40	P53829	373 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	BOR1	P53838	576 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	ODC1	Q03028	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	PIR3	Q03180	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	HSP31	Q04432	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	HNT3	Q08702	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	PDR10	P51533	1564 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	SNT1	P25357	1226 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	VHC1	P38329	1120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	WSC2	P53832	503 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	SCW10	Q04951	389 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	SIL1	Q08199	421 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	MMS1	Q06211	1407 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	DNF2	Q12675	1612 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	HIP1	P06775	603 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	REC107	P21651	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	DSL1	P53847	754 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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