RNA–Protein interactions for RNA: YGL063W

PUS2, Transcript of Mitochondrial tRNA:pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS2, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS2	YGL063W	DST1	P07273	309 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	ADH7	P25377	361 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	NAM9	P27929	486 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	ICE2	P40499	491 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	CUP9	P41817	306 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	TVP15	Q03860	143 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	SWF1	Q04629	336 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	OMS1	Q06668	471 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	NCA2	Q12374	616 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	CYT1	P07143	309 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	RPL43B	P0CX26	92 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	YCR051W	P25631	222 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	ZIP1	P31111	875 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	FMP52	P40008	231 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	YIL001W	P40560	513 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	BAP3	P41815	604 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	AIM22	P47051	409 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	ATF2	P53296	535 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	OAZ1	Q02803	292 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	STE7	P06784	515 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	PHO87	P25360	923 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	YCR102C	P25608	368 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	DCG1	P32460	244 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	ATG7	P38862	630 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	VPS52	P39904	641 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	MEP2	P41948	499 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	NAS6	P50086	228 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	REC102	Q02721	264 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	NUP53	Q03790	475 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	YDR124W	Q04608	324 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	DOA1	P36037	715 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	STE24	P47154	453 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	IRC15	Q02733	499 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	TRP3	P00937	484 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	SLY41	P22215	453 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	SPO23	P33757	523 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	MOH1	P38191	138 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	MPS3	P47069	682 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	YMR210W	Q03649	449 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	SFH1	Q06168	426 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	GET4	Q12125	312 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PUS2	YGL063W	APN1	P22936	367 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	MNN2	P38069	597 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	YBR139W	P38109	508 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	BZZ1	P38822	633 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	SHU2	P38957	223 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	YEN1	P40028	759 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	MSC1	Q03104	513 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	ATG34	Q12292	412 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	STP22	P25604	385 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	CAF4	P36130	643 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	GID8	P40208	455 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	PHB1	P40961	287 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	FMP32	P43557	207 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	PTR3	P43606	678 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	MUP1	P50276	574 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	ECM11	Q04110	302 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	YEH1	Q07804	573 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	REX3	Q12090	404 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	HUA2	Q12134	243 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	NTO1	Q12311	748 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	ATO2	P32907	282 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	SPC42	P36094	363 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	COS111	P38308	924 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	GTO1	P48239	356 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	RNT1	Q02555	471 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	VPS16	Q03308	798 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	ESA1	Q08649	445 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	HTA2	P04912	132 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	YMR085W	P0CF18	432 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PUS2	YGL063W	ARE1	P25628	610 aa		11.42	□□□□□ -0.58

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 39.4 ms