RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 MROH8Q9H579 483 aa22.46■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 EDIL3O43854 480 aa22.45■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 BCRP11274 1271 aa22.45■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 ZNF174Q15697 407 aa22.45■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 LETM2Q2VYF4 491 aa22.45■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.45■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.45■■□□□ 1.19
CLN8-208ENST00000635751 CA12O43570 354 aa22.45■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 ALDH1A1P00352 501 aa22.45■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 UBXN2AP68543 259 aa22.45■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 C17orf99Q6UX52 265 aa22.45■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 MAP2K2P36507 400 aa22.44■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 ISM2Q6H9L7 571 aa22.44■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 SMC2O95347 1197 aa22.43■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 BMP15O95972 392 aa22.43■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 MCM7P33993 719 aa22.43■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 SREBF1P36956 1147 aa22.43■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 GRIN1Q05586 938 aa22.43■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 SPECC1Q5M775 1068 aa22.43■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.43■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.43■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 MAF1Q9H063 256 aa22.43■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 IFNKQ9P0W0 207 aa22.43■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.43■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 PFASO15067 1338 aa22.43■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 ARHGAP4P98171 946 aa22.43■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 MYL5Q02045 173 aa22.43■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.43■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.43■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 MGAMO43451 1857 aa22.42■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 USP11P51784 963 aa22.42■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 POSTNQ15063 836 aa22.42■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 KANK3Q6NY19 840 aa22.42■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 RMDN3Q96TC7 470 aa22.42■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 MMP19Q99542 508 aa22.42■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 FCER1AP12319 257 aa22.41■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 C1QTNF8P60827 252 aa22.41■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 CNTN2Q02246 1040 aa22.41■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 KCTD2Q14681 263 aa22.41■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 ARID5BQ14865 1188 aa22.41■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 RPTORQ8N122 1335 aa22.41■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 TDP2O95551 362 aa22.41■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 SKILP12757 684 aa22.41■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 HSPA6P17066 643 aa22.41■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.41■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 CSRNP2Q9H175 543 aa22.41■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 PXMP2Q9NR77 195 aa22.41■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 POTEB2H3BUK9 544 aa22.4■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 PGK2P07205 417 aa22.4■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 CCZ1BP86790 482 aa22.4■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 FANCCQ00597 558 aa22.4■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.4■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.4■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.4■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.4■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 MCM3APO60318 1980 aa22.39■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.39■■□□□ 1.18
CLN8-208ENST00000635751 TBC1D8O95759 1140 aa22.39■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 CYP3A4P08684 503 aa22.39■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 PTGDRQ13258 359 aa22.39■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 GPR142Q7Z601 462 aa22.39■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.39■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 IL31RAQ8NI17 732 aa22.39■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 FERMT2Q96AC1 680 aa22.39■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 FOXN1O15353 648 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 CBFA2T2O43439 604 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 MAPK4P31152 587 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 PGM5Q15124 567 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 TMC6Q7Z403 805 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 TRPA1O75762 1119 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 ZNF76P36508 570 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 SMARCE1Q969G3 411 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 RNF186Q9NXI6 227 aa22.38■■□□□ 1.17
CLN8-208ENST00000635751 DACH1Q9UI36 760 aa22.38■■□□□ 1.17
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