RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627393.1

PCNP-208, Transcript of PEST proteolytic signal containing nuclear protein, human

TSL 2 BASIC

Gene PCNP, Length 136 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCNP-208	ENST00000627393	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	SPATA5	Q8NB90	893 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	CHST13	Q8NET6	341 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	REPS2	Q8NFH8	660 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	EPC1	Q9H2F5	836 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	GOPC	Q9HD26	462 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	VTA1	Q9NP79	307 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	CDH22	Q9UJ99	828 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	CA14	Q9ULX7	337 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	TMX2	Q9Y320	296 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	IGF2R	P11717	2491 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	PATJ	Q8NI35	1801 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	KRBA1	A5PL33	1030 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	POTEM	A6NI47	508 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	SPINK2	P20155	84 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	THPO	P40225	353 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	ITIH3	Q06033	890 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	PDE4B	Q07343	736 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	LPAL2	Q16609	132 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	DUSP6	Q16828	381 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	POTEG	Q6S5H5	508 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	C7orf31	Q8N865	590 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	XAGE2	Q96GT9	111 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	WNT16	Q9UBV4	365 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	AKAP13	Q12802	2813 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393		A6NJR5	290 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	ATP2A1	O14983	1001 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	ARHGAP6	O43182	974 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	LILRB5	O75023	590 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	LRP3	O75074	770 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	CIAO1	O76071	339 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	KCNK5	O95279	499 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	SEC24B	O95487	1268 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	RET	P07949	1114 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	CSRP2	Q16527	193 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	CASP10	Q92851	521 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	GATA6	Q92908	595 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	KIFC2	Q96AC6	838 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PCNP-208	ENST00000627393	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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