RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, human

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3B-215	ENST00000621029	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		33.34	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	FGB	P02675	491 aa		33.34	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	RETREG2	Q8NC44	543 aa		33.34	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	KCNB2	Q92953	911 aa		33.34	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		33.34	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	PSEN2	P49810	448 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	PTGIS	Q16647	500 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	UBE2S	Q16763	222 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029		Q6ZUG5	572 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	33.33	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	33.33	■■■□□ 2.93
SEMA3B-215	ENST00000621029	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		33.32	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	PPFIA4	O75335	1185 aa		33.32	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	MFSD10	Q14728	455 aa		33.32	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		33.32	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		33.32	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		33.32	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		33.31	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	FIBP	O43427	364 aa		33.31	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	PSMA5	P28066	241 aa		33.31	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	NAPA	P54920	295 aa		33.31	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	APOBR	Q0VD83	1088 aa		33.31	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		33.31	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		33.31	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	NLRX1	Q86UT6	975 aa		33.31	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	BRF1	Q92994	677 aa		33.31	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		33.3	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	33.3	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	BFSP2	Q13515	415 aa		33.3	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	NEDD9	Q14511	834 aa		33.3	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		33.3	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	ICAM3	P32942	547 aa		33.29	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		33.29	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		33.29	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		33.29	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		33.29	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	F2	P00734	622 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	RPS6KB1	P23443	525 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	CDC27	P30260	824 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	SESTD1	Q86VW0	696 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	HERVK_113	Q902F9	699 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	RCAN1	P53805	252 aa		33.27	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		33.27	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		33.27	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		33.27	■■■□□ 2.92
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZBBX	A8MT70	800 aa		33.26	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	PITPNM1	O00562	1244 aa		33.26	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	SP4	Q02446	784 aa		33.26	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	FUT2	Q10981	343 aa		33.26	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	SEMA3F	Q13275	785 aa		33.26	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		33.25	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	33.25	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	33.25	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	DNAJB2	P25686	324 aa		33.25	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	ADCY7	P51828	1080 aa		33.25	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	RASIP1	Q5U651	963 aa		33.25	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		33.25	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		33.25	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	METTL7B	Q6UX53	244 aa		33.25	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	GUCD1	Q96NT3	240 aa		33.25	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	33.25	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	33.25	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	HAS3	O00219	553 aa		33.24	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	PFKM	P08237	780 aa		33.24	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	IQCF3	P0C7M6	154 aa		33.24	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		33.23	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	RFC2	P35250	354 aa		33.23	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	CAGE1	Q8TC20	777 aa		33.23	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	CDHR1	Q96JP9	859 aa		33.23	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		33.23	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		33.23	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	SMCO2	A6NFE2	343 aa		33.22	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029		H3BRB1	525 aa		33.22	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	STXBP3	O00186	592 aa		33.22	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	LGALS2	P05162	132 aa		33.22	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		33.22	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	TIFA	Q96CG3	184 aa		33.22	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	GPRASP2	Q96D09	838 aa		33.22	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		33.22	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		33.22	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
SEMA3B-215	ENST00000621029	BARHL2	Q9NY43	387 aa		33.22	■■■□□ 2.91

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms