RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 SESTD1Q86VW0 696 aa22.34■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.34■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 NEK9Q8TD19 979 aa22.34■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 INSL6Q9Y581 213 aa22.34■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 POTEB3A0JP26 581 aa22.33■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 SLC27A2O14975 620 aa22.33■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 CXCL10P02778 98 aa22.33■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 RBL2Q08999 1139 aa22.33■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.33■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 POTEBQ6S5H4 581 aa22.33■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.33■■□□□ 1.17
SGMS1-208ENST00000608287 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 SPRED2Q7Z698 418 aa22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 PRRX2Q99811 253 aa22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 CPVLQ9H3G5 476 aa22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 NCK2O43639 380 aa22.31■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 DEFB103AP81534 67 aa22.31■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 WTAPQ15007 396 aa22.31■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 NECTIN1Q15223 517 aa22.31■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 DNERQ8NFT8 737 aa22.31■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 PKN1Q16512 942 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF318Q5VUA4 2279 aa22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 ANTXR2P58335 489 aa22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 CHMP4BP1P59074 171 aa22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 ZP2Q05996 745 aa22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 RNF20Q5VTR2 975 aa22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 SENP2Q9HC62 589 aa22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 EMSYQ7Z589 1322 aa22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 AMHP03971 560 aa22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 PRC1O43663 620 aa22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 ST18O60284 1047 aa22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 CKBP12277 381 aa22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 CALML3P27482 149 aa22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 MCM5P33992 734 aa22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 BANK1Q8NDB2 785 aa22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
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SGMS1-208ENST00000608287 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-208ENST00000608287 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 NFIBO00712 420 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 EDNRBP24530 442 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 PTPN5P54829 565 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 USH1GQ495M9 461 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 C7orf31Q8N865 590 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 MAF1Q9H063 256 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 KLRF2D3W0D1 207 aa22.25■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 NBNO60934 754 aa22.25■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 FOXK2Q01167 660 aa22.25■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 PTK7Q13308 1070 aa22.25■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.25■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.25■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.25■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 LGR5O75473 907 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 GH1P01241 217 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 MMP3P08254 477 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 GRM4Q14833 912 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 DGKDQ16760 1214 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 MTA3Q9BTC8 594 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 LY9Q9HBG7 655 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 MYH6P13533 1939 aa22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 H3BNC9 293 aa22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 TROAPQ12815 778 aa22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 GPNMBQ14956 572 aa22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 COL19A1Q14993 1142 aa22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-208ENST00000608287 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.23■■□□□ 1.15
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