RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601357.6

SSBP4-209, Transcript of single stranded DNA binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SSBP4, Length 606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4-209ENST00000601357 CHD9Q3L8U1 2897 aa26.12■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 GRXCR1A8MXD5 290 aa26.11■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 ZNF286BP0CG31 522 aa26.11■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 CHMP4BP1P59074 171 aa26.11■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 PTGISQ16647 500 aa26.11■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 OTOP2Q7RTS6 562 aa26.11■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa26.11■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 KCNB2Q92953 911 aa26.11■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 CUL5Q93034 780 aa26.11■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 SPATA33Q96N06 139 aa26.11■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 KATNAL1Q9BW62 490 aa26.11■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 PBX4Q9BYU1 374 aa26.11■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa26.11■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 GBF1Q92538 1859 aa26.11■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 PBX2P40425 430 aa26.1■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 PSEN2P49810 448 aa26.1■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 SEMA3FQ13275 785 aa26.1■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 KRT32Q14532 448 aa26.1■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 MFSD10Q14728 455 aa26.1■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 GNPTABQ3T906 1256 aa26.1■■□□□ 1.77
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SSBP4-209ENST00000601357 SLC17A8Q8NDX2 589 aa26.1■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 TCEANC2Q96MN5 208 aa26.1■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.1■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa26.09■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa26.09■■□□□ 1.77
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SSBP4-209ENST00000601357 RFC2P35250 354 aa26.09■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 BFSP2Q13515 415 aa26.09■■□□□ 1.77
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SSBP4-209ENST00000601357 CCDC82Q8N4S0 544 aa26.09■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 TIFAQ96CG3 184 aa26.09■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 BCAS3Q9H6U6 928 aa26.09■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 PSTPIP2Q9H939 334 aa26.09■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 HDAC6Q9UBN7 1215 aa26.09■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 NOD1Q9Y239 953 aa26.09■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 A0A0C4DFX4 3053 aa26.09■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 SORBS3O60504 671 aa26.08■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 RBL2Q08999 1139 aa26.08■■□□□ 1.77
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SSBP4-209ENST00000601357 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa26.08■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 C7orf31Q8N865 590 aa26.08■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 C16orf70Q9BSU1 422 aa26.08■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 DOCK5Q9H7D0 1870 aa26.08■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa26.08■■□□□ 1.77
SSBP4-209ENST00000601357 FIBPO43427 364 aa26.07■■□□□ 1.76
SSBP4-209ENST00000601357 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
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SSBP4-209ENST00000601357 CAGE1Q8TC20 777 aa26.07■■□□□ 1.76
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SSBP4-209ENST00000601357 ALG1Q9BT22 464 aa26.07■■□□□ 1.76
SSBP4-209ENST00000601357 ZNF576Q9H609 170 aa26.07■■□□□ 1.76
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SSBP4-209ENST00000601357 RTEL1Q9NZ71 1219 aa26.07■■□□□ 1.76
SSBP4-209ENST00000601357 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
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SSBP4-209ENST00000601357 METTL7BQ6UX53 244 aa26.05■■□□□ 1.76
SSBP4-209ENST00000601357 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
SSBP4-209ENST00000601357 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa26.05■■□□□ 1.76
SSBP4-209ENST00000601357 CHD7Q9P2D1 2997 aa26.04■■□□□ 1.76
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SSBP4-209ENST00000601357 RTN1Q16799 776 aa26.04■■□□□ 1.76
SSBP4-209ENST00000601357 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa26.04■■□□□ 1.76
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SSBP4-209ENST00000601357 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa26.03■■□□□ 1.76
SSBP4-209ENST00000601357 LGALS2P05162 132 aa26.03■■□□□ 1.76
SSBP4-209ENST00000601357 HOXC8P31273 242 aa26.03■■□□□ 1.76
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SSBP4-209ENST00000601357 CYFIP1Q7L576 1253 aa26.03■■□□□ 1.76
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SSBP4-209ENST00000601357 SNX14Q9Y5W7 946 aa26.03■■□□□ 1.76
SSBP4-209ENST00000601357 TET1Q8NFU7 2136 aa26.02■■□□□ 1.76
SSBP4-209ENST00000601357 H3BRB1 525 aa26.02■■□□□ 1.76
SSBP4-209ENST00000601357 CKBP12277 381 aa26.02■■□□□ 1.76
SSBP4-209ENST00000601357 CPA1P15085 419 aa26.02■■□□□ 1.76
SSBP4-209ENST00000601357 SELPP16109 830 aa26.02■■□□□ 1.76
SSBP4-209ENST00000601357 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
SSBP4-209ENST00000601357 TYW1BQ6NUM6 668 aa26.02■■□□□ 1.76
SSBP4-209ENST00000601357 LRRC8DQ7L1W4 858 aa26.02■■□□□ 1.76
SSBP4-209ENST00000601357 NLRX1Q86UT6 975 aa26.02■■□□□ 1.76
SSBP4-209ENST00000601357 GPRASP2Q96D09 838 aa26.02■■□□□ 1.76
SSBP4-209ENST00000601357 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
SSBP4-209ENST00000601357 MSRAQ9UJ68 235 aa26.02■■□□□ 1.76
SSBP4-209ENST00000601357 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
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