RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600209.5

FCHO1-232, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 881 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-232ENST00000600209 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.75■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 SMPD1P17405 629 aa22.74■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 SEMA3FQ13275 785 aa22.74■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 Q4G0T1 1027 aa22.74■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.74■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 RARBP10826 455 aa22.73■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 CAPN2P17655 700 aa22.73■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 LHX8Q68G74 356 aa22.73■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.73■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 ARIH2O95376 493 aa22.72■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 TDP2O95551 362 aa22.72■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 GJB1P08034 283 aa22.72■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 ARP10275 920 aa22.72■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 NEDD9Q14511 834 aa22.72■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 LY6KQ17RY6 165 aa22.72■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 PRR16Q569H4 304 aa22.72■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.72■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 LENG9Q96B70 501 aa22.72■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.72■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 ADCY6O43306 1168 aa22.71■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 SP2Q02086 613 aa22.71■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 RESTQ13127 1097 aa22.71■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 FERMT3Q86UX7 667 aa22.71■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.71■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.71■■□□□ 1.23
FCHO1-232ENST00000600209 SGPL1O95470 568 aa22.7■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 GH1P01241 217 aa22.7■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 NKX3-2P78367 333 aa22.7■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.7■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 DEFB118Q96PH6 123 aa22.7■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.7■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 HTTP42858 3142 aa22.7■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 NFASCO94856 1347 aa22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 TBX3O15119 743 aa22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 ATP9AO75110 1047 aa22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 KCNA2P16389 499 aa22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 ATP2B1P20020 1258 aa22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 GJA9P57773 515 aa22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 LAMC2Q13753 1193 aa22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 TTC38Q5R3I4 469 aa22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 ANO1Q5XXA6 986 aa22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 ABHD8Q96I13 439 aa22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 SPC25Q9HBM1 224 aa22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.69■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 MSH4O15457 936 aa22.68■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 DDIT3P35638 169 aa22.68■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 GJA8P48165 433 aa22.68■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 TLK2Q86UE8 772 aa22.68■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 TNS4Q8IZW8 715 aa22.68■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 COPS5Q92905 334 aa22.68■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 FAM20AQ96MK3 541 aa22.68■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.68■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.68■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.68■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 WNT7AO00755 349 aa22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 SLC37A4O43826 429 aa22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 BRD1O95696 1058 aa22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 GGPS1O95749 300 aa22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 F13A1P00488 732 aa22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 ARHGAP1Q07960 439 aa22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 PKP1Q13835 747 aa22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 ZNF174Q15697 407 aa22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 RIT2Q99578 217 aa22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 SDF4Q9BRK5 362 aa22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.66■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
FCHO1-232ENST00000600209 NEMFO60524 1076 aa22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms