RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589232.5

GTF3C2-AS1-206, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 254 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TAPT1Q6NXT6 567 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FRMD5Q7Z6J6 570 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CPXCR1Q8N123 301 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ADSSL1Q8N142 457 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CCDC82Q8N4S0 544 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 BANK1Q8NDB2 785 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 WNT8BQ93098 351 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CHMP4CQ96CF2 233 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DDX11Q96FC9 970 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MEIS3Q99687 375 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DBNDD2Q9BQY9 259 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SMOC2Q9H3U7 446 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CABP5Q9NP86 173 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TMX2Q9Y320 296 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZNF292O60281 2723 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TTC3P53804 2025 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MIA3Q5JRA6 1907 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KIF28PB7ZC32 967 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PROB1E7EW31 1015 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 STXBP3O00186 592 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PRKAB2O43741 272 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GJB5O95377 273 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IGHDP01880 384 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ACTN1P12814 892 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PURAQ00577 322 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MBTPS1Q14703 1052 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NBPF20Q3BBV1 942 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 EPC2Q52LR7 807 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PACS2Q86VP3 889 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ITPRIPQ8IWB1 547 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 EXOC8Q8IYI6 725 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MAGEB6Q8N7X4 407 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TMEM105Q8N8V8 129 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FAM133AQ8N9E0 248 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SDR42E1Q8WUS8 393 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 COPS5Q92905 334 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SPC25Q9HBM1 224 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PRKAG3Q9UGI9 489 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TNNQ9UQP3 1299 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DNAH14Q0VDD8 3507 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PATJQ8NI35 1801 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TPRP12270 2363 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 EPG5Q9HCE0 2579 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 COL4A3Q01955 1670 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SPTBN2O15020 2390 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DOCK6Q96HP0 2047 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LOC730098B7Z3J9 87 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 WDR46O15213 610 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GRM6O15303 877 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KDM4AO75164 1064 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PFKMP08237 780 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MYL3P08590 195 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LINC00271P0C7V0 271 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NBL1P41271 181 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SNAP25P60880 206 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ICA1Q05084 483 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GPM6BQ13491 265 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CAMK1Q14012 370 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HIC1Q14526 733 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FAM47CQ5HY64 1035 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GORABQ5T7V8 394 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TYW1BQ6NUM6 668 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RASGRP2Q7LDG7 609 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TTC6Q86TZ1 520 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TMEM57Q8N5G2 664 aa4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms