RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570641.1

SPNS2-202, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPNS2, Length 783 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SPNS2-202ENST00000570641 RGS2P41220 211 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS2-202ENST00000570641 PSMC4P43686 418 aa20.36■□□□□ 0.85
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SPNS2-202ENST00000570641 PPP2R5CQ13362 524 aa20.36■□□□□ 0.85
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