RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567949.5

CTU2-210, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-210ENST00000567949 CEP55Q53EZ4 464 aa22.88■■□□□ 1.25
CTU2-210ENST00000567949 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.88■■□□□ 1.25
CTU2-210ENST00000567949 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.88■■□□□ 1.25
CTU2-210ENST00000567949 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.88■■□□□ 1.25
CTU2-210ENST00000567949 LRRC10BA6NIK2 292 aa22.88■■□□□ 1.25
CTU2-210ENST00000567949 E9PMD0 336 aa22.88■■□□□ 1.25
CTU2-210ENST00000567949 PLA2G4BP0C869 781 aa22.88■■□□□ 1.25
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CTU2-210ENST00000567949 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CTU2-210ENST00000567949 UBXN2AP68543 259 aa22.88■■□□□ 1.25
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CTU2-210ENST00000567949 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.88■■□□□ 1.25
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CTU2-210ENST00000567949 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.88■■□□□ 1.25
CTU2-210ENST00000567949 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.88■■□□□ 1.25
CTU2-210ENST00000567949 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
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CTU2-210ENST00000567949 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.87■■□□□ 1.25
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CTU2-210ENST00000567949 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.87■■□□□ 1.256e-7■■■■■ 32.1
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CTU2-210ENST00000567949 BICDL2A1A5D9 508 aa22.86■■□□□ 1.25
CTU2-210ENST00000567949 KCNJ18B7U540 433 aa22.86■■□□□ 1.25
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CTU2-210ENST00000567949 KCNJ12Q14500 433 aa22.86■■□□□ 1.25
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CTU2-210ENST00000567949 PTPN21Q16825 1174 aa22.86■■□□□ 1.25
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CTU2-210ENST00000567949 THAP9Q9H5L6 903 aa22.86■■□□□ 1.25
CTU2-210ENST00000567949 COL20A1Q9P218 1284 aa22.86■■□□□ 1.25
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CTU2-210ENST00000567949 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.86■■□□□ 1.25
CTU2-210ENST00000567949 POTEFA5A3E0 1075 aa22.85■■□□□ 1.25
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CTU2-210ENST00000567949 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
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CTU2-210ENST00000567949 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.85■■□□□ 1.25
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CTU2-210ENST00000567949 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.84■■□□□ 1.25
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CTU2-210ENST00000567949 SLC12A3P55017 1021 aa22.84■■□□□ 1.25
CTU2-210ENST00000567949 PPP2R5CQ13362 524 aa22.84■■□□□ 1.25
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CTU2-210ENST00000567949 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.83■■□□□ 1.25
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CTU2-210ENST00000567949 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.83■■□□□ 1.25
CTU2-210ENST00000567949 ARP10275 920 aa22.82■■□□□ 1.24
CTU2-210ENST00000567949 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CTU2-210ENST00000567949 DSG3P32926 999 aa22.82■■□□□ 1.24
CTU2-210ENST00000567949 PRKG1Q13976 671 aa22.82■■□□□ 1.24
CTU2-210ENST00000567949 CENPPQ6IPU0 288 aa22.82■■□□□ 1.24
CTU2-210ENST00000567949 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.82■■□□□ 1.24
CTU2-210ENST00000567949 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.82■■□□□ 1.24
CTU2-210ENST00000567949 REPS2Q8NFH8 660 aa22.82■■□□□ 1.24
CTU2-210ENST00000567949 WNK4Q96J92 1243 aa22.82■■□□□ 1.24
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