RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		10.82	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	APOA5	Q6Q788	366 aa		10.82	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		10.82	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	ALG1	Q9BT22	464 aa		10.82	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	PITPNM1	O00562	1244 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	ZBTB43	O43298	467 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	FIBP	O43427	364 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	PFKM	P08237	780 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	IQCF3	P0C7M6	154 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	DNAJB2	P25686	324 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	RFC2	P35250	354 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	NEDD9	Q14511	834 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	RTN1	Q16799	776 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	NLRX1	Q86UT6	975 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	10.81	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	TIFA	Q96CG3	184 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		10.81	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	HAS3	O00219	553 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	REC8	O95072	547 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	F2	P00734	622 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF286B	P0CG31	522 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	ACTN1	P12814	892 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	HSPA4	P34932	840 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	CAGE1	Q8TC20	777 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNB2	Q92953	911 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	USP26	Q9BXU7	913 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	PBX4	Q9BYU1	374 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	10.8	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF576	Q9H609	170 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	MSRA	Q9UJ68	235 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		10.8	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	ZBBX	A8MT70	800 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479		H3BRB1	525 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	PBX2	P40425	430 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	GRIN2C	Q14957	1233 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	RAB30	Q15771	203 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	UBE2S	Q16763	222 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	METTL7B	Q6UX53	244 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479		Q6ZUG5	572 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	MYLIP	Q8WY64	445 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	VWCE	Q96DN2	955 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		10.79	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	MAFG	O15525	162 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	CPA1	P15085	419 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	SELP	P16109	830 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	PSMA5	P28066	241 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	CDC27	P30260	824 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	RCAN1	P53805	252 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	NAPA	P54920	295 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	APOBR	Q0VD83	1088 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	FUT2	Q10981	343 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	SEMA3F	Q13275	785 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	PTK7	Q13308	1070 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	GPRASP2	Q96D09	838 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	CDHR1	Q96JP9	859 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	GPR20	Q99678	358 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		10.78	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
KIFC3-231	ENST00000567479	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		10.78	□□□□□ -0.68

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