RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563645.1

GDE1-202, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 2

Gene GDE1, Length 769 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-202ENST00000563645 KCNT2Q6UVM3 1135 aa5.77□□□□□ -1.49
GDE1-202ENST00000563645 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP5.77□□□□□ -1.49
GDE1-202ENST00000563645 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP5.77□□□□□ -1.49
GDE1-202ENST00000563645 DDX11Q96FC9 970 aa5.77□□□□□ -1.49
GDE1-202ENST00000563645 GORASP1Q9BQQ3 440 aa5.77□□□□□ -1.49
GDE1-202ENST00000563645 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
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GDE1-202ENST00000563645 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
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GDE1-202ENST00000563645 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa5.76□□□□□ -1.49
GDE1-202ENST00000563645 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
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GDE1-202ENST00000563645 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
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GDE1-202ENST00000563645 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
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GDE1-202ENST00000563645 SARSP49591 514 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
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GDE1-202ENST00000563645 NFIXQ14938 502 aa5.72□□□□□ -1.49
GDE1-202ENST00000563645 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
GDE1-202ENST00000563645 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
GDE1-202ENST00000563645 EXOC2Q96KP1 924 aa5.72□□□□□ -1.49
GDE1-202ENST00000563645 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
GDE1-202ENST00000563645 TRAF6Q9Y4K3 522 aa5.72□□□□□ -1.49
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