RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559339.1

SNX1-205, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNX1, Length 101 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-205ENST00000559339 RTEL1Q9NZ71 1219 aa5.01□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 NOD1Q9Y239 953 aa5.01□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 DNAH12Q6ZR08 3092 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 ESYT2A0FGR8 921 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 TRIM43BA6NCK2 446 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 STXBP3O00186 592 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 KIAA0355O15063 1070 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 CTAGE5O15320 804 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 ARIH2O95376 493 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 GGPS1O95749 300 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 TIMP1P01033 207 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 IFNAR1P17181 557 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 ICAM3P32942 547 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 ZNF76P36508 570 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 CDK7P50613 346 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 NLRP5P59047 1200 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 CCT2P78371 535 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 FPGSQ05932 587 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 FAAP100Q0VG06 881 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 FUT2Q10981 343 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 STK3Q13188 491 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 MYSM1Q5VVJ2 828 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 METTL7BQ6UX53 244 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 FAM126BQ8IXS8 530 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 CCDC155Q8N6L0 562 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 WASF1Q92558 559 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 COPS5Q92905 334 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 BADQ92934 168 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 PHKBQ93100 1093 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 GPRASP2Q96D09 838 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 FAM212AQ96EL1 285 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 SENP7Q9BQF6 1050 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 SLC26A6Q9BXS9 759 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 ZMYND12Q9H0C1 365 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 HIPK3Q9H422 1215 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 SH3GLB2Q9NR46 395 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 PCDHA6Q9UN73 950 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa5□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 FRMPD4Q14CM0 1322 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 LAMA3Q16787 3333 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 H3BRB1 525 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 B4GALT4O60513 344 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 RGS20O76081 388 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 DEXIO95424 95 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 GNAT1P11488 350 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 PTGS1P23219 599 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 SREBF1P36956 1147 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 NEK4P51957 841 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 PSMC6P62333 389 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 SETQ01105 290 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 ARHGAP1Q07960 439 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.611e-7■□□□□ 10.2
SNX1-205ENST00000559339 BFSP2Q13515 415 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 GSE1Q14687 1217 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 PTGISQ16647 500 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 UBE2SQ16763 222 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 KIAA0753Q2KHM9 967 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 NBPF20Q3BBV1 942 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 HSDL1Q3SXM5 330 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 LRIT3Q3SXY7 679 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 CEP55Q53EZ4 464 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 TMEM63BQ5T3F8 832 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 GALNT17Q6IS24 598 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 MFSD5Q6N075 450 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 CYFIP1Q7L576 1253 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 SLC43A3Q8NBI5 491 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 RETREG2Q8NC44 543 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 IL27Q8NEV9 243 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 IL31RAQ8NI17 732 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 SDF4Q9BRK5 362 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 ANO3Q9BYT9 981 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 C22orf23Q9BZE7 217 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SNX1-205ENST00000559339 PRO3102Q9H379 93 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms