RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557477.1

PRPF39-212, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF39, Length 724 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-212ENST00000557477 A0A1W2PQ27 194 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF39-212ENST00000557477 A0A1W2PQ64 194 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF39-212ENST00000557477 A0A1W2PQC6 194 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF39-212ENST00000557477 A0A1W2PQD8 194 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF39-212ENST00000557477 FITM1A5D6W6 292 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF39-212ENST00000557477 NEMP1O14524 444 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF39-212ENST00000557477 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.42□□□□□ -1.38
PRPF39-212ENST00000557477 PSPNO60542 156 aa6.42□□□□□ -1.38
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PRPF39-212ENST00000557477 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF39-212ENST00000557477 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF39-212ENST00000557477 KIF18BQ86Y91 864 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF39-212ENST00000557477 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.42□□□□□ -1.38
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PRPF39-212ENST00000557477 USP7Q93009 1102 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF39-212ENST00000557477 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF39-212ENST00000557477 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF39-212ENST00000557477 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF39-212ENST00000557477 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.42□□□□□ -1.38
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PRPF39-212ENST00000557477 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF39-212ENST00000557477 KCNK3O14649 394 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF39-212ENST00000557477 GSTA4O15217 222 aa6.41□□□□□ -1.38
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PRPF39-212ENST00000557477 KRT15P19012 456 aa6.41□□□□□ -1.38
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PRPF39-212ENST00000557477 GDNFP39905 211 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF39-212ENST00000557477 ADCYAP1R1P41586 468 aa6.41□□□□□ -1.38
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PRPF39-212ENST00000557477 NR0B2Q15466 257 aa6.41□□□□□ -1.38
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PRPF39-212ENST00000557477 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.41□□□□□ -1.38
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PRPF39-212ENST00000557477 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF39-212ENST00000557477 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.41□□□□□ -1.38
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PRPF39-212ENST00000557477 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.41□□□□□ -1.38
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PRPF39-212ENST00000557477 CPEP16870 476 aa6.4□□□□□ -1.38
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PRPF39-212ENST00000557477 GPR19Q15760 415 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF39-212ENST00000557477 BICRALQ6AI39 1079 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF39-212ENST00000557477 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF39-212ENST00000557477 PANK1Q8TE04 598 aa6.39□□□□□ -1.39
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