RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555690.5

PPP4R4-204, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, human

TSL 3

Gene PPP4R4, Length 680 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4R4-204	ENST00000555690	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	SPATA33	Q96N06	139 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	REV3L	O60673	3130 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	HAS3	O00219	553 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	BAIAP3	O94812	1187 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	GGPS1	O95749	300 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	CKB	P12277	381 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	SP2	Q02086	613 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	KIF28P	B7ZC32	967 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	PPFIA4	O75335	1185 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	28.3	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	CCND2	P30279	289 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	ANTXR2	P58335	489 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	28.3	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	RBL2	Q08999	1139 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	28.3	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	MAP4K1	Q92918	833 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	TRANK1	O15050	2925 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	ARHGEF15	O94989	841 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	28.29	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	KCNJ6	P48051	423 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	TAP1	Q03518	808 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	ASB2	Q96Q27	587 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	NBN	O60934	754 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	TGFB3	P10600	412 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	PTK7	Q13308	1070 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	WNT8B	Q93098	351 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	EPOP	A6NHQ4	379 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	28.27	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	28.27	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	28.27	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	HIC1	Q14526	733 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	28.27	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	28.27	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	28.27	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PPP4R4-204	ENST00000555690	TLL1	O43897	1013 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	CXCL10	P02778	98 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	TCTN1	Q2MV58	587 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	28.26	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	28.25	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	MYL10	Q9BUA6	226 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	28.25	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	DEFB103A	P81534	67 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	LY9	Q9HBG7	655 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	TNFRSF10A	O00220	468 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	28.23	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	28.23	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	KRT40	Q6A162	431 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	SPRED2	Q7Z698	418 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	LCHN	A4D1U4	455 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	MBTPS1	Q14703	1052 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	28.22	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	28.22	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	28.22	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	28.22	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	MAP3K14	Q99558	947 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690		H3BRB1	525 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	PRC1	O43663	620 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	DDAH1	O94760	285 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	ICAM3	P32942	547 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	CASC1	Q6TDU7	716 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	SERINC5	Q86VE9	423 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	28.21	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	PTPRS	Q13332	1948 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PPP4R4-204	ENST00000555690	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	28.2	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	STAM2	O75886	525 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	LGALS2	P05162	132 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	KIF5B	P33176	963 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	THPO	P40225	353 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	TFF2	Q03403	129 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	IKBKE	Q14164	716 aa		28.2	■■■□□ 2.1

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