RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552295.5

BEST3-211, Transcript of bestrophin 3, humanhuman

TSL 5

Gene BEST3, Length 720 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3-211ENST00000552295 CAPN12Q6ZSI9 719 aa9.51□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa9.51□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 STK32AQ8WU08 396 aa9.51□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 STAG1Q8WVM7 1258 aa9.51□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 CNTNAP1P78357 1384 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 MYO1BO43795 1136 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 ENTPD3O75355 529 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 FGRP09769 529 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 CPA1P15085 419 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 PTPRAP18433 802 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 CASTP20810 708 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 PSMA5P28066 241 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 GRIK1P39086 918 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 PLCD1P51178 756 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 AKNAD1Q5T1N1 836 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 FKBP1CQ5VVH2 108 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 ZFPM1Q8IX07 1006 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 NEK1Q96PY6 1258 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 PBX4Q9BYU1 374 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 C7orf69Q9H7B7 122 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 INCENPQ9NQS7 918 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 TMOD2Q9NZR1 351 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 STIM2Q9P246 746 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 NEDD4P46934 1319 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 ATRNL1Q5VV63 1379 aa9.5□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 TCP10L2B9ZVM9 353 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 TM4SF5O14894 197 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 TCP10Q12799 353 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 RUFY3Q7L099 469 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 NCAPG2Q86XI2 1143 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 TRIM42Q8IWZ5 723 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 AMOTL1Q8IY63 956 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 NCOA7Q8NI08 942 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 TTC14Q96N46 770 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 VEZTQ9HBM0 779 aa9.49□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 B4E1Z4 1266 aa9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 ORC4O43929 436 aa9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 PCP11498 1178 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 EPHA1P21709 976 aa9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 RPS6KB1P23443 525 aa9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 NEK4P51957 841 aa9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 GP2P55259 537 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 ANTXR2P58335 489 aa9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 GABPAQ06546 454 aa9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 RNF43Q68DV7 783 aa9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 MFSD6Q6ZSS7 791 aa9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 C16orf86Q6ZW13 317 aa9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 TTC6Q86TZ1 520 aa9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 FAM83AQ86UY5 434 aa9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 STK11IPQ8N1F8 1099 aa9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 SLC44A5Q8NCS7 719 aa9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 FAM151AQ8WW52 585 aa9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 DYNLL2Q96FJ2 89 aa9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 MYRFLQ96LU7 910 aa9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 EHD4Q9H223 541 aa9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 CNNM2Q9H8M5 875 aa9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 PGAP2Q9UHJ9 254 aa9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 HACL1Q9UJ83 578 aa9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 PRDM1O75626 825 aa9.47□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 HLA-DOAP06340 250 aa9.47□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 TXKP42681 527 aa9.47□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 PDE4BQ07343 736 aa9.47□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 TRDNQ13061 729 aa9.47□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 CYB5R4Q7L1T6 521 aa9.47□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 CEP120Q8N960 986 aa9.47□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 SNX21Q969T3 373 aa9.47□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 TCEANC2Q96MN5 208 aa9.47□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 KRT23Q9C075 422 aa9.47□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 PDRG1Q9NUG6 133 aa9.47□□□□□ -0.89
BEST3-211ENST00000552295 GGA3Q9NZ52 723 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms