RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546930.5

CS-206, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-206ENST00000546930 F13A1P00488 732 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 FOSP01100 380 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 CCL5P13501 91 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 CYP3A7P24462 503 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 HOXD10P28358 340 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 ICAM3P32942 547 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 GRIN1Q05586 938 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 PDE4DQ08499 809 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 IL17AQ16552 155 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 MYSM1Q5VVJ2 828 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 B3GNT9Q6UX72 402 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 SEPT14Q6ZU15 432 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 NEK8Q86SG6 692 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 JADE2Q9NQC1 790 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 PTPRSQ13332 1948 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 CCNE2O96020 404 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 SPIRE1Q08AE8 756 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 TRIM29Q14134 588 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 BECN1Q14457 450 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 PTPAQ15257 358 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 STXBP2Q15833 593 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 LETM2Q2VYF4 491 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 CEP55Q53EZ4 464 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 MCTP1Q6DN14 999 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 TEX2Q8IWB9 1127 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 BICD2Q8TD16 824 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 USP28Q96RU2 1077 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 GLT8D2Q9H1C3 349 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 KCNMB3Q9NPA1 279 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 VAV3Q9UKW4 847 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 CLIC4Q9Y696 253 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 EML1O00423 815 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 SEPT4O43236 478 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 PGK1P00558 417 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 XBP1P17861 261 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 ATP2B1P20020 1258 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 BEX3Q00994 111 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 ZNF174Q15697 407 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 UGCGQ16739 394 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 Q4G0T1 1027 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 PRR16Q569H4 304 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 TTC38Q5R3I4 469 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 MFSD14CQ5VZR4 134 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 MOXD1Q6UVY6 613 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 NIPA1Q7RTP0 329 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 PLA2G4DQ86XP0 818 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 LRRC15Q8TF66 581 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 SLC5A5Q92911 643 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 GPRASP2Q96D09 838 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 MTMR9Q96QG7 549 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 PCYT2Q99447 389 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 KCNH7Q9NS40 1196 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 H3BQV1 296 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 FIBPO43427 364 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 PSMD10O75832 226 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 GGPS1O95749 300 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 AKR1A1P14550 325 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 MCM7P33993 719 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 NKX3-2P78367 333 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 MTMR1Q13613 665 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 HIC1Q14526 733 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 HSDL1Q3SXM5 330 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 DUSP28Q4G0W2 176 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 IFFO2Q5TF58 517 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 PPP4R3AQ6IN85 833 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 XRRA1Q6P2D8 792 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 TLK2Q86UE8 772 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 TRIM50Q86XT4 487 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 KLHDC9Q8NEP7 349 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 UNC45AQ9H3U1 944 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-206ENST00000546930 SLC5A4Q9NY91 659 aa9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 122.7 ms