RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	CCND2	P30279	289 aa		18.61	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	TAP1	Q03518	808 aa		18.61	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	RBL2	Q08999	1139 aa		18.61	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		18.61	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	NCOA7	Q8NI08	942 aa		18.61	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	IL31RA	Q8NI17	732 aa		18.61	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	18.61	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	SPATA33	Q96N06	139 aa		18.61	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		18.6	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777		E7EWF7	191 aa		18.6	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	CYTH3	O43739	400 aa		18.6	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	TLL1	O43897	1013 aa		18.6	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	TGFB3	P10600	412 aa		18.6	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	SP2	Q02086	613 aa		18.6	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	TROAP	Q12815	778 aa		18.6	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	PTK7	Q13308	1070 aa		18.6	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		18.6	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		18.6	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		18.6	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		18.6	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		18.6	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	PTPRS	Q13332	1948 aa		18.6	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		18.59	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	EPOP	A6NHQ4	379 aa		18.59	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	NBN	O60934	754 aa		18.59	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	ARHGEF15	O94989	841 aa		18.59	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	CXCL10	P02778	98 aa		18.59	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	IL27	Q8NEV9	243 aa		18.59	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		18.59	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	TTC28	Q96AY4	2481 aa		18.58	■□□□□ 0.57
DDX11-222	ENST00000542777	SGSM2	O43147	1006 aa		18.58	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		18.58	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		18.58	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		18.58	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		18.58	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	18.58	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		18.58	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		18.57	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	DEFB103A	P81534	67 aa		18.57	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	HIC1	Q14526	733 aa		18.57	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	TCTN1	Q2MV58	587 aa		18.57	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	18.57	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		18.57	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	WNT8B	Q93098	351 aa		18.57	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		18.57	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	ANTXR2	P58335	489 aa		18.56	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	IKBKE	Q14164	716 aa		18.56	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		18.56	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	KRT40	Q6A162	431 aa		18.56	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		18.56	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	SPRED2	Q7Z698	418 aa		18.56	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	MAP4K1	Q92918	833 aa		18.56	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	18.56	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		18.56	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	LCHN	A4D1U4	455 aa		18.55	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	EFCAB14	O75071	495 aa		18.55	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	18.55	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	TFF2	Q03403	129 aa		18.55	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	GRB10	Q13322	594 aa		18.55	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	18.55	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		18.54	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		18.54	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777		H3BRB1	525 aa		18.54	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	STAM2	O75886	525 aa		18.54	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	LGALS2	P05162	132 aa		18.54	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	BMP1	P13497	986 aa		18.54	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	ICAM3	P32942	547 aa		18.54	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	THPO	P40225	353 aa		18.54	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	MBTPS1	Q14703	1052 aa		18.54	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	AAK1	Q2M2I8	961 aa		18.54	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	SERINC5	Q86VE9	423 aa		18.54	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		18.54	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	18.54	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		18.54	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	MAP3K14	Q99558	947 aa		18.54	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	RAD9A	Q99638	391 aa		18.54	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		18.54	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		18.53	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		18.53	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		18.53	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	LGR5	O75473	907 aa		18.53	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	GJB5	O95377	273 aa		18.53	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	RSPH10B	P0C881	870 aa		18.53	■□□□□ 0.56
DDX11-222	ENST00000542777	NEDD9	Q14511	834 aa		18.53	■□□□□ 0.56

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