RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527421.5

UBXN1-208, Transcript of UBX domain protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN1, Length 1,085 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1-208ENST00000527421 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
UBXN1-208ENST00000527421 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.41■■□□□ 1.02
UBXN1-208ENST00000527421 MYSM1Q5VVJ2 828 aa21.41■■□□□ 1.02
UBXN1-208ENST00000527421 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.41■■□□□ 1.02
UBXN1-208ENST00000527421 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.41■■□□□ 1.02
UBXN1-208ENST00000527421 TRPV6Q9H1D0 765 aa21.41■■□□□ 1.02
UBXN1-208ENST00000527421 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.41■■□□□ 1.02
UBXN1-208ENST00000527421 PCDHA6Q9UN73 950 aa21.41■■□□□ 1.02
UBXN1-208ENST00000527421 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.41■■□□□ 1.02
UBXN1-208ENST00000527421 SORBS3O60504 671 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN1-208ENST00000527421 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
UBXN1-208ENST00000527421 FPGSQ05932 587 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN1-208ENST00000527421 NBPF20Q3BBV1 942 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN1-208ENST00000527421 NLRX1Q86UT6 975 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN1-208ENST00000527421 SPATA33Q96N06 139 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN1-208ENST00000527421 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN1-208ENST00000527421 MLXIPQ9HAP2 919 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN1-208ENST00000527421 DOCK5Q9H7D0 1870 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN1-208ENST00000527421 SMCO2A6NFE2 343 aa21.39■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa21.39■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 CHMP4BP1P59074 171 aa21.39■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 SP2Q02086 613 aa21.39■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.39■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 PHKBQ93100 1093 aa21.39■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 HIPK3Q9H422 1215 aa21.39■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 FOSP01100 380 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.38■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 ZNF286BP0CG31 522 aa21.38■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 IFNAR1P17181 557 aa21.38■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 SEMA3FQ13275 785 aa21.38■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 NEDD9Q14511 834 aa21.38■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 NTRK3Q16288 839 aa21.38■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 MFSD5Q6N075 450 aa21.38■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 GPRASP2Q96D09 838 aa21.38■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 CDHR1Q96JP9 859 aa21.38■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.38■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.38■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 ESYT2A0FGR8 921 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 AP3B2Q13367 1082 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 PKN1Q16512 942 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 METTL7BQ6UX53 244 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 TMEM199Q8N511 208 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 KAT2BQ92831 832 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 ANO3Q9BYT9 981 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 NOP56O00567 594 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 CPLX1O14810 134 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 PPFIA3O75145 1194 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 PPFIA4O75335 1185 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 F2P00734 622 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 CYP2C18P33260 490 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 SHHQ15465 462 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 PGBD1Q96JS3 809 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 ITGB5P18084 799 aa21.35■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 PSEN2P49810 448 aa21.35■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 EPHB4P54760 987 aa21.35■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 STK3Q13188 491 aa21.35■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 MTMR1Q13613 665 aa21.35■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 MFSD10Q14728 455 aa21.35■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.35■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 SESTD1Q86VW0 696 aa21.35■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.35■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 LRCH3Q96II8 777 aa21.35■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 ZMYND12Q9H0C1 365 aa21.35■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 C6orf50Q9HD87 102 aa21.35■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 TMEM260Q9NX78 707 aa21.35■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 NOD1Q9Y239 953 aa21.35■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa21.35■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 CYP2C9P11712 490 aa21.34■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 CSF2RAP15509 400 aa21.34■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.34■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 IL17RAQ96F46 866 aa21.34■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 ALG1Q9BT22 464 aa21.34■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.34■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 LAMA3Q16787 3333 aa21.34■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.33■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 TANC1Q9C0D5 1861 aa21.33■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 HAS3O00219 553 aa21.33■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 GNA11P29992 359 aa21.33■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 SREBF1P36956 1147 aa21.33■■□□□ 1.01
UBXN1-208ENST00000527421 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms