RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514128.1

SIMC1-211, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 697 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-211ENST00000514128 TGFB3P10600 412 aa28.16■■■□□ 2.1
SIMC1-211ENST00000514128 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
SIMC1-211ENST00000514128 BMP2KLQ5H9B9 411 aa28.16■■■□□ 2.1
SIMC1-211ENST00000514128 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
SIMC1-211ENST00000514128 CREB3L3Q68CJ9 461 aa28.16■■■□□ 2.1
SIMC1-211ENST00000514128 AFAP1L1Q8TED9 768 aa28.16■■■□□ 2.1
SIMC1-211ENST00000514128 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa28.16■■■□□ 2.1
SIMC1-211ENST00000514128 KIAA0753Q2KHM9 967 aa28.15■■■□□ 2.1
SIMC1-211ENST00000514128 RNF20Q5VTR2 975 aa28.15■■■□□ 2.1
SIMC1-211ENST00000514128 MYSM1Q5VVJ2 828 aa28.15■■■□□ 2.1
SIMC1-211ENST00000514128 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa28.15■■■□□ 2.1
SIMC1-211ENST00000514128 PRDM12Q9H4Q4 367 aa28.15■■■□□ 2.1
SIMC1-211ENST00000514128 MLXIPQ9HAP2 919 aa28.15■■■□□ 2.1
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SIMC1-211ENST00000514128 STAM2O75886 525 aa28.14■■■□□ 2.1
SIMC1-211ENST00000514128 SMARCA1P28370 1054 aa28.14■■■□□ 2.1
SIMC1-211ENST00000514128 RABGGTBP53611 331 aa28.14■■■□□ 2.1
SIMC1-211ENST00000514128 PPP2R2DQ66LE6 453 aa28.14■■■□□ 2.1
SIMC1-211ENST00000514128 TET1Q8NFU7 2136 aa28.14■■■□□ 2.1
SIMC1-211ENST00000514128 VWCEQ96DN2 955 aa28.14■■■□□ 2.1
SIMC1-211ENST00000514128 HDAC6Q9UBN7 1215 aa28.14■■■□□ 2.1
SIMC1-211ENST00000514128 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa28.14■■■□□ 2.1
SIMC1-211ENST00000514128 SLC12A7Q9Y666 1083 aa28.14■■■□□ 2.1
SIMC1-211ENST00000514128 FRMPD4Q14CM0 1322 aa28.14■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 PPFIA4O75335 1185 aa28.13■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 LIFRP42702 1097 aa28.13■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 SLC9A7Q96T83 725 aa28.13■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 DOCK5Q9H7D0 1870 aa28.12■■■□□ 2.09
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SIMC1-211ENST00000514128 PLEKHA8P1O95397 391 aa28.12■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 SELPP16109 830 aa28.12■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 NECTIN1Q15223 517 aa28.12■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 HSDL1Q3SXM5 330 aa28.12■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 LRRC8DQ7L1W4 858 aa28.12■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa28.12■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 PARNO95453 639 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 RXRAP19793 462 aa28.11■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 CHD9Q3L8U1 2897 aa28.1■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 HAS3O00219 553 aa28.1■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 BAIAP3O94812 1187 aa28.1■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 SP2Q02086 613 aa28.1■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP28.1■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 CTAGE1Q96RT6 745 aa28.1■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 FIBPO43427 364 aa28.09■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 KCNJ6P48051 423 aa28.09■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 RBL2Q08999 1139 aa28.09■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 PTK7Q13308 1070 aa28.09■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 NEDD9Q14511 834 aa28.09■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 USP17L6PQ6QN14 398 aa28.09■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa28.09■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 MICU3Q86XE3 530 aa28.09■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa28.09■■■□□ 2.09
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SIMC1-211ENST00000514128 PIK3CDO00329 1044 aa28.08■■■□□ 2.09
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SIMC1-211ENST00000514128 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 XRRA1Q6P2D8 792 aa28.08■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa28.08■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 RTEL1Q9NZ71 1219 aa28.08■■■□□ 2.09
SIMC1-211ENST00000514128 ICAM3P32942 547 aa28.07■■■□□ 2.08
SIMC1-211ENST00000514128 PCNX4Q63HM2 1172 aa28.07■■■□□ 2.08
SIMC1-211ENST00000514128 METTL7BQ6UX53 244 aa28.07■■■□□ 2.08
SIMC1-211ENST00000514128 SKAP1Q86WV1 359 aa28.07■■■□□ 2.08
SIMC1-211ENST00000514128 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa28.06■■■□□ 2.08
SIMC1-211ENST00000514128 KIF28PB7ZC32 967 aa28.06■■■□□ 2.08
SIMC1-211ENST00000514128 CDC45O75419 566 aa28.06■■■□□ 2.08
SIMC1-211ENST00000514128 SGMS1Q86VZ5 419 aa28.06■■■□□ 2.08
SIMC1-211ENST00000514128 USP38Q8NB14 1042 aa28.06■■■□□ 2.08
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SIMC1-211ENST00000514128 PPM1EQ8WY54 764 aa28.06■■■□□ 2.08
SIMC1-211ENST00000514128 C16orf70Q9BSU1 422 aa28.06■■■□□ 2.08
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SIMC1-211ENST00000514128 H3BRB1 525 aa28.05■■■□□ 2.08
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SIMC1-211ENST00000514128 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
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SIMC1-211ENST00000514128 CYFIP1Q7L576 1253 aa28.05■■■□□ 2.08
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SIMC1-211ENST00000514128 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
SIMC1-211ENST00000514128 PTPRSQ13332 1948 aa28.04■■■□□ 2.08
SIMC1-211ENST00000514128 C17orf102A2RUQ5 167 aa28.04■■■□□ 2.08
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SIMC1-211ENST00000514128 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa28.04■■■□□ 2.08
SIMC1-211ENST00000514128 HERC6Q8IVU3 1022 aa28.04■■■□□ 2.08
SIMC1-211ENST00000514128 USP26Q9BXU7 913 aa28.04■■■□□ 2.08
SIMC1-211ENST00000514128 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
SIMC1-211ENST00000514128 KAT6AQ92794 2004 aa28.04■■■□□ 2.08
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