RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513533.1

HOXC-AS2-201, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS2, Length 504 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MSH4O15457 936 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MTMR1Q13613 665 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PGM5Q15124 567 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPRYD7Q5W111 196 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SMC1BQ8NDV3 1235 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SHCBP1Q8NEM2 672 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ETNPPLQ8TBG4 499 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TAAR1Q96RJ0 339 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BPIFA3Q9BQP9 254 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 JADE2Q9NQC1 790 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CYP39A1Q9NYL5 469 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DNM3Q9UQ16 869 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SMCHD1A6NHR9 2005 aa13.71□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RLFQ13129 1914 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FRMPD4Q14CM0 1322 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BIN1O00499 593 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NR3C2P08235 984 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FCER1AP12319 257 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PLCG1P19174 1290 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CDC25AP30304 524 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 UBXN2AP68543 259 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 STXBP2Q15833 593 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 E2F4Q16254 413 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NT5DC1Q5TFE4 455 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 WDR78Q5VTH9 848 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PDXDC2PQ6P474 469 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SLC30A10Q6XR72 485 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SLC5A5Q92911 643 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCDC102AQ96A19 550 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GPRASP2Q96D09 838 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PDCD2LQ9BRP1 358 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DNAJC25Q9H1X3 360 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TUFT1Q9NNX1 390 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RIPK3Q9Y572 518 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa13.69□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 POTEMA6NI47 508 aa13.69□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PP2D1A8MPX8 630 aa13.69□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RPA1P27694 616 aa13.69□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PDE4DQ08499 809 aa13.69□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PPP2R5CQ13362 524 aa13.69□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HYIQ5T013 277 aa13.69□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GPAT2Q6NUI2 795 aa13.69□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa13.69□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 VSIG10LQ86VR7 867 aa13.69□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MMP19Q99542 508 aa13.69□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SLC5A4Q9NY91 659 aa13.69□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BTBD7Q9P203 1132 aa13.69□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa13.69□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 STRNO43815 780 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RPN1P04843 607 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KRT18P05783 430 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ERCC3P19447 782 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SFNP31947 248 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ERVK-9P63128 1117 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ERVK-24P63145 666 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PLCB2Q00722 1185 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KRT76Q01546 638 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCDC173Q0VFZ6 552 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SREBF2Q12772 1141 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DPYDQ12882 1025 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KCNB1Q14721 858 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EPHA7Q15375 998 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RGMBQ6NW40 437 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CNNM4Q6P4Q7 775 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KCNV1Q6PIU1 500 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RDM1Q8NG50 284 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RAD54LQ92698 747 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LENG9Q96B70 501 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PLIN2Q99541 437 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C7orf25Q9BPX7 421 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CBX8Q9HC52 389 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KCNH7Q9NS40 1196 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EXOC1Q9NV70 894 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KBTBD4Q9NVX7 518 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAN1B1Q9UKM7 699 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KIAA1024Q9UPX6 916 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SAMM50Q9Y512 469 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A087X0B3 334 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BTBD19C9JJ37 291 aa13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms