RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510628.1

SMIM14-204, Transcript of small integral membrane protein 14, human

TSL 3

Gene SMIM14, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMIM14-204	ENST00000510628	EXOC2	Q96KP1	924 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	ARNTL	O00327	626 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	ATF2	P15336	505 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	PFKL	P17858	780 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	FBLN1	P23142	703 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	HMGA2	P52926	109 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	CPZ	Q66K79	652 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	TMEM260	Q9NX78	707 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	CLEC1B	Q9P126	229 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	NOBOX	O60393	691 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	MAPKAPK2	P49137	400 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	CORO7	P57737	925 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	SDE2	Q6IQ49	451 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	JAML	Q86YT9	394 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	APPBP2	Q92624	585 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	JMJD8	Q96S16	334 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	MENT	Q9BUN1	341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	FANCL	Q9NW38	375 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMIM14-204	ENST00000510628	BLACE	A4D250	179 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	SH3D21	A4FU49	640 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	SLPI	P03973	132 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	ZNF20	P17024	532 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	HTRA3	P83110	453 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	KCNAB2	Q13303	367 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	NTRK3	Q16288	839 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	CCDC103	Q8IW40	242 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	MRI	Q9BWK5	157 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	C7orf72	A4D263	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	ENPP3	O14638	875 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	NPHS1	O60500	1241 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	CDC45	O75419	566 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	C6	P13671	934 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	LTBR	P36941	435 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	MC3R	P41968	323 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	MVK	Q03426	396 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	NR1I3	Q14994	352 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	INF2	Q27J81	1249 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	MBLAC2	Q68D91	279 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	USP53	Q70EK8	1073 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	DCAF4	Q8WV16	495 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	DIO2	Q92813	273 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	LOXL4	Q96JB6	756 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628		A0A1W2PQ27	194 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628		A0A1W2PQ64	194 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628		A0A1W2PQC6	194 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628		A0A1W2PQD8	194 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	ASMTL	O95671	621 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	HSD3B2	P26439	372 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	GTF2A2	P52657	109 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	TCEA2	Q15560	299 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	CARF	Q8N187	725 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628		Q8N1X5	172 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	GPR27	Q9NS67	375 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	ASXL2	Q76L83	1435 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	PLD2	O14939	933 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	DBH	P09172	617 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	LCP1	P13796	627 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	GJA9	P57773	515 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMIM14-204	ENST00000510628	GABRE	P78334	506 aa		4.8	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms