RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508936.1

SMAD1-AS2-201, SMAD1 antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD1-AS2, Length 1,090 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PLS3P13797 630 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GNPTABQ3T906 1256 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MBLAC2Q68D91 279 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LMF1Q96S06 567 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DTLQ9NZJ0 730 aa6.49□□□□□ -1.37
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SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FGD4Q96M96 766 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC12A7Q9Y666 1083 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 COMTP21964 271 aa6.47□□□□□ -1.37
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SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.47□□□□□ -1.37
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SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IFNL2Q8IZJ0 200 aa6.46□□□□□ -1.38
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SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.46□□□□□ -1.38
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SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
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SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CEP68Q76N32 757 aa6.45□□□□□ -1.38
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SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 X6R8D5 127 aa6.45□□□□□ -1.38
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SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DGCR2P98153 550 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SCRN1Q12765 414 aa6.44□□□□□ -1.38
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SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IQCEQ6IPM2 695 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
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SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NUDT11Q96G61 164 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
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SMAD1-AS2-201ENST00000508936 Q8N1Y9 231 aa6.42□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.42□□□□□ -1.38
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SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PPT2Q9UMR5 302 aa6.42□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MYO1BO43795 1136 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KLHL18O94889 574 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CHGBP05060 677 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 COL6A1P12109 1028 aa6.41□□□□□ -1.38
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SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MRGPRGQ86SM5 289 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMEM169Q96HH4 297 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DLL4Q9NR61 685 aa6.41□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PLSCR1O15162 318 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KCNH1O95259 989 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 STEAP3Q658P3 488 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FUKQ8N0W3 1084 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 VOPP1Q96AW1 172 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM89AQ96GI7 184 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AJUBAQ96IF1 538 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CRBNQ96SW2 442 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.4□□□□□ -1.38
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MAKP20794 623 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.39□□□□□ -1.39
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RAD17O75943 681 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C1SP09871 688 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BCL6P41182 706 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TUBA3CQ13748 450 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.38□□□□□ -1.39
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