RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RTEL1Q9NZ71 1219 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPFIA4O75335 1185 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STAM2O75886 525 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRT32Q14532 448 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MFSD10Q14728 455 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSDL1Q3SXM5 330 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMTC3Q6ZXV5 915 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SESTD1Q86VW0 696 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PBX4Q9BYU1 374 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PSTPIP2Q9H939 334 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FRMPD4Q14CM0 1322 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZBBXA8MT70 800 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PIK3CDO00329 1044 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PITPNM1O00562 1244 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MEIS2O14770 477 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PFKMP08237 780 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PBX2P40425 430 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIAA0753Q2KHM9 967 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADCK5Q3MIX3 580 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TSGA10IPQ3SY00 556 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC155Q8N6L0 562 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HDAC6Q9UBN7 1215 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SCN5AQ14524 2016 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 F2P00734 622 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IQCF3P0C7M6 154 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RFC2P35250 354 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 APOA5Q6Q788 366 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF576Q9H609 170 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MSRAQ9UJ68 235 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VWCEQ96DN2 955 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP26.84■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZBTB43O43298 467 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FIBPO43427 364 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ACTN1P12814 892 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ICAM3P32942 547 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NEDD9Q14511 834 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GRIN2CQ14957 1233 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAB30Q15771 203 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCNX4Q63HM2 1172 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 XRRA1Q6P2D8 792 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CAGE1Q8TC20 777 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HAS3O00219 553 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NOP56O00567 594 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FOSL2P15408 326 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FGD1P98174 961 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RTN1Q16799 776 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BCAS3Q9H6U6 928 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NEFLP07196 543 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYFIP1Q7L576 1253 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NLRX1Q86UT6 975 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AFAP1L1Q8TED9 768 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CTAGE1Q96RT6 745 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SEMA3FQ13275 785 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UBE2SQ16763 222 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C16orf70Q9BSU1 422 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TANC1Q9C0D5 1861 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPDYE3A6NKU9 549 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GOLGA8AA7E2F4 631 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GOLGA8BA8MQT2 603 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SELPP16109 830 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 METTL7BQ6UX53 244 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GBF1Q92538 1859 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DOCK5Q9H7D0 1870 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 H3BRB1 525 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RABGGTBP53611 331 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTK7Q13308 1070 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRRC8DQ7L1W4 858 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC28A3Q9HAS3 691 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 V9GY48 417 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LGALS2P05162 132 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CKBP12277 381 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CPA1P15085 419 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SP4Q02446 784 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WWC2Q6AWC2 1192 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SENP7Q9BQF6 1050 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP26Q9BXU7 913 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCDHA6Q9UN73 950 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms