RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503459.1

TNNT2-223, Transcript of troponin T2, cardiac type, human

TSL 5

Gene TNNT2, Length 699 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNNT2-223	ENST00000503459	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		14.61	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	NCOR1	O75376	2440 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	KLRF2	D3W0D1	207 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	TRAF1	Q13077	416 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	IKBKE	Q14164	716 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	SPRED2	Q7Z698	418 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	SPATA33	Q96N06	139 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	RAD9A	Q99638	391 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	EMSY	Q7Z589	1322 aa		14.6	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	PPFIA4	O75335	1185 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	RGS20	O76081	388 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	GGPS1	O95749	300 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	PGM5	Q15124	567 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	SEC23A	Q15436	765 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		14.59	□□□□□ -0.07
TNNT2-223	ENST00000503459	SI	P14410	1827 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	LGR5	O75473	907 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	TGFB3	P10600	412 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	CCND2	P30279	289 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	ERVK-21	P61565	698 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	MBTPS1	Q14703	1052 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	TCTN1	Q2MV58	587 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	SERINC5	Q86VE9	423 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	IL31RA	Q8NI17	732 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	WNT8B	Q93098	351 aa		14.58	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	LINC01553	A4QN01	128 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	IGHD	P01880	384 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	POLR2M	P0CAP2	368 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	TRDN	Q13061	729 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	GRM4	Q14833	912 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	HOMER1	Q86YM7	354 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		14.57	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	COL4A6	Q14031	1691 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	SORBS3	O60504	671 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	AMH	P03971	560 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	HOXC8	P31273	242 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	PLA2G5	P39877	138 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	THPO	P40225	353 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	IL25	Q9H293	177 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	INSL6	Q9Y581	213 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		14.56	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	ERICH2	A1L162	156 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	CAND2	O75155	1236 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	STAM2	O75886	525 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	LGALS2	P05162	132 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	RSPH10B	P0C881	870 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	SP2	Q02086	613 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	HIC1	Q14526	733 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	PIGS	Q96S52	555 aa		14.55	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459		H3BRB1	525 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	14.54	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		14.54	□□□□□ -0.08
TNNT2-223	ENST00000503459	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08

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