RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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RBM39-241ENST00000496183 BCAS3Q9H6U6 928 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-241ENST00000496183 AQP7O14520 342 aa7.15□□□□□ -1.26
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RBM39-241ENST00000496183 RBL2Q08999 1139 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-241ENST00000496183 SPIRE1Q08AE8 756 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-241ENST00000496183 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.15□□□□□ -1.26
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RBM39-241ENST00000496183 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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RBM39-241ENST00000496183 GRK3P35626 688 aa7.14□□□□□ -1.27
RBM39-241ENST00000496183 GPR85P60893 370 aa7.14□□□□□ -1.27
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RBM39-241ENST00000496183 OSBP2Q969R2 916 aa7.14□□□□□ -1.27
RBM39-241ENST00000496183 MKL1Q969V6 931 aa7.14□□□□□ -1.27
RBM39-241ENST00000496183 ZBTB8AQ96BR9 441 aa7.14□□□□□ -1.27
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RBM39-241ENST00000496183 VMACQ2NL98 169 aa7.13□□□□□ -1.27
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RBM39-241ENST00000496183 KDM2BQ8NHM5 1336 aa7.12□□□□□ -1.27
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RBM39-241ENST00000496183 SOD2P04179 222 aa7.1□□□□□ -1.27
RBM39-241ENST00000496183 HOXA5P20719 270 aa7.1□□□□□ -1.27
RBM39-241ENST00000496183 SLURP1P55000 103 aa7.1□□□□□ -1.27
RBM39-241ENST00000496183 GJA9P57773 515 aa7.1□□□□□ -1.27
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RBM39-241ENST00000496183 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
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RBM39-241ENST00000496183 NTRK3Q16288 839 aa7.09□□□□□ -1.27
RBM39-241ENST00000496183 OTOP3Q7RTS5 596 aa7.09□□□□□ -1.27
RBM39-241ENST00000496183 TTLL11Q8NHH1 800 aa7.09□□□□□ -1.27
RBM39-241ENST00000496183 TMEM209Q96SK2 561 aa7.09□□□□□ -1.27
RBM39-241ENST00000496183 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.09□□□□□ -1.27
RBM39-241ENST00000496183 MSCO60682 206 aa7.08□□□□□ -1.28
RBM39-241ENST00000496183 EFCAB14O75071 495 aa7.08□□□□□ -1.28
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