RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496076.1

CLTC-208, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 2

Gene CLTC, Length 678 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-208ENST00000496076 CD248Q9HCU0 757 aa7.38□□□□□ -1.23
CLTC-208ENST00000496076 ZNF652Q9Y2D9 606 aa7.38□□□□□ -1.23
CLTC-208ENST00000496076 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CLTC-208ENST00000496076 HGSO14964 777 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CLTC-208ENST00000496076 MYO1BO43795 1136 aa7.37□□□□□ -1.23
CLTC-208ENST00000496076 RECKO95980 971 aa7.37□□□□□ -1.23
CLTC-208ENST00000496076 GJA8P48165 433 aa7.37□□□□□ -1.23
CLTC-208ENST00000496076 PPP2CBP62714 309 aa7.37□□□□□ -1.23
CLTC-208ENST00000496076 PPP2CAP67775 309 aa7.37□□□□□ -1.23
CLTC-208ENST00000496076 NCAPHQ15003 741 aa7.37□□□□□ -1.23
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CLTC-208ENST00000496076 ARRDC4Q8NCT1 418 aa7.37□□□□□ -1.23
CLTC-208ENST00000496076 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa7.37□□□□□ -1.23
CLTC-208ENST00000496076 DEF6Q9H4E7 631 aa7.37□□□□□ -1.23
CLTC-208ENST00000496076 JADE2Q9NQC1 790 aa7.37□□□□□ -1.23
CLTC-208ENST00000496076 CROTQ9UKG9 612 aa7.37□□□□□ -1.23
CLTC-208ENST00000496076 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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CLTC-208ENST00000496076 RCBTB1Q8NDN9 531 aa7.36□□□□□ -1.23
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CLTC-208ENST00000496076 TCRBV5S2A0A599 114 aa7.35□□□□□ -1.23
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CLTC-208ENST00000496076 STEAP3Q658P3 488 aa7.35□□□□□ -1.23
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CLTC-208ENST00000496076 PALM2Q8IXS6 379 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-208ENST00000496076 SEC16BQ96JE7 1060 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-208ENST00000496076 PTPN18Q99952 460 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-208ENST00000496076 ZNF747Q9BV97 191 aa7.35□□□□□ -1.23
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CLTC-208ENST00000496076 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa7.35□□□□□ -1.23
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CLTC-208ENST00000496076 TBX1O43435 398 aa7.34□□□□□ -1.23
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CLTC-208ENST00000496076 TADA3O75528 432 aa7.34□□□□□ -1.23
CLTC-208ENST00000496076 AMHP03971 560 aa7.34□□□□□ -1.23
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CLTC-208ENST00000496076 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.34□□□□□ -1.23
CLTC-208ENST00000496076 VPS11Q9H270 941 aa7.34□□□□□ -1.23
CLTC-208ENST00000496076 FTSJ1Q9UET6 329 aa7.34□□□□□ -1.23
CLTC-208ENST00000496076 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa7.34□□□□□ -1.23
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CLTC-208ENST00000496076 WASF3Q9UPY6 502 aa7.33□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.33□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 H7BY64 318 aa7.32□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 OVOL3O00110 214 aa7.32□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 SCG5P05408 212 aa7.32□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 VAMP1P23763 118 aa7.32□□□□□ -1.24
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CLTC-208ENST00000496076 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.32□□□□□ -1.24
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CLTC-208ENST00000496076 KLHL36Q8N4N3 616 aa7.32□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 LRP2BPQ9P2M1 347 aa7.32□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 CPP00450 1065 aa7.31□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 LCP1P13796 627 aa7.31□□□□□ -1.24
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CLTC-208ENST00000496076 TMC5Q6UXY8 1006 aa7.31□□□□□ -1.24
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CLTC-208ENST00000496076 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 CCDC140Q96MF4 163 aa7.31□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.31□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 WRNIP1Q96S55 665 aa7.31□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 MENTQ9BUN1 341 aa7.31□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 CLDND1Q9NY35 253 aa7.31□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 STRIP2Q9ULQ0 834 aa7.31□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 TCAF1Q9Y4C2 921 aa7.31□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 PATE3B3GLJ2 98 aa7.3□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 ZNF623O75123 536 aa7.3□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 DGKIO75912 1065 aa7.3□□□□□ -1.24
CLTC-208ENST00000496076 KCNJ6P48051 423 aa7.3□□□□□ -1.24
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