RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 CD8BP10966 210 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRC-212ENST00000491302 PDE6AP16499 860 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRC-212ENST00000491302 ITKQ08881 620 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRC-212ENST00000491302 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC181Q5TID7 509 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRC-212ENST00000491302 EP400NLQ6ZTU2 488 aa10.4□□□□□ -0.74
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PTPRC-212ENST00000491302 CABP7Q86V35 215 aa10.36□□□□□ -0.75
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PTPRC-212ENST00000491302 MENTQ9BUN1 341 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRC-212ENST00000491302 SLC6A20Q9NP91 592 aa10.36□□□□□ -0.75
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PTPRC-212ENST00000491302 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
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PTPRC-212ENST00000491302 CCDC39Q9UFE4 941 aa10.35□□□□□ -0.75
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PTPRC-212ENST00000491302 SYDE2Q5VT97 1194 aa10.34□□□□□ -0.75
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PTPRC-212ENST00000491302 AMY2BP19961 511 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 NEK2P51955 445 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 FMNL3Q8IVF7 1028 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa10.33□□□□□ -0.76
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