RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.93■■□□□ 1.58
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USP40-215ENST00000484528 C16orf70Q9BSU1 422 aa24.86■■□□□ 1.57
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USP40-215ENST00000484528 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
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USP40-215ENST00000484528 HERC6Q8IVU3 1022 aa24.85■■□□□ 1.57
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USP40-215ENST00000484528 FIBPO43427 364 aa24.83■■□□□ 1.57
USP40-215ENST00000484528 STAM2O75886 525 aa24.83■■□□□ 1.57
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USP40-215ENST00000484528 WDR5P61964 334 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
USP40-215ENST00000484528 ZNF618Q5T7W0 954 aa24.83■■□□□ 1.57
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