RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475060.1

CTPS1-207, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 813 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-207ENST00000475060 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 MAF1Q9H063 256 aa7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 VPS16Q9H269 839 aa7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 VAT1LQ9HCJ6 419 aa7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 OGFRQ9NZT2 677 aa7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 CDC23Q9UJX2 597 aa7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 VAV3Q9UKW4 847 aa7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 PCDHA12Q9UN75 941 aa7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 FRMPD4Q14CM0 1322 aa7.26□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 A0A1W2PRG0 241 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 ANO9A1A5B4 782 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 CYP11B2P19099 503 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 CASQ1P31415 396 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 EIF6P56537 245 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 GNG11P61952 73 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 KRT83P78385 493 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 PPP2R3AQ06190 1150 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 COASYQ13057 564 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 MCM6Q14566 821 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 ECM1Q16610 540 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 UBE2SQ16763 222 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 AOC3Q16853 763 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 VWA3BQ502W6 1294 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 FAM26FQ5R3K3 315 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 FAM160B2Q86V87 743 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 FBXO11Q86XK2 927 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 CREBRFQ8IUR6 639 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 MYOCDQ8IZQ8 938 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 CEP112Q8N8E3 955 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 MSANTD4Q8NCY6 345 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 ERMNQ8TAM6 284 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 ZNF592Q92610 1267 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 DDX12PQ92771 950 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 KCTD10Q9H3F6 313 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 SH2D4AQ9H788 454 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 TMOD2Q9NZR1 351 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 KCND2Q9NZV8 630 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 FBXL5Q9UKA1 691 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 PNMA2Q9UL42 364 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 FAM184BQ9ULE4 1060 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 PRR12Q9ULL5 1215 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 UBE4BO95155 1302 aa7.25□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 POTEB2H3BUK9 544 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 PJA2O43164 708 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 PPIP5K2O43314 1243 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 GH2P01242 217 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 PLA2G4BP0C869 781 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 BCRP11274 1271 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 KCNA3P22001 575 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 ANXA13P27216 316 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 CHRNA5P30532 468 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 SLC16A2P36021 539 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 STAT2P52630 851 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 JAG1P78504 1218 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 ITIH3Q06033 890 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 PPP2R5CQ13362 524 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 ELF2Q15723 593 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 PTPN21Q16825 1174 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 NIPA1Q7RTP0 329 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 TRIM59Q8IWR1 403 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 CCDC65Q8IXS2 484 aa7.24□□□□□ -1.25
CTPS1-207ENST00000475060 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
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