RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474882.2

MYCBP2-205, Transcript of MYC binding protein 2, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene MYCBP2, Length 393 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYCBP2-205	ENST00000474882	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	FUCA1	P04066	466 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	CD8B	P10966	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	GNAT1	P11488	350 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	COL6A2	P12110	1019 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	PDE6A	P16499	860 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	GRIK1	P39086	918 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	JAM2	P57087	298 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	OCRL	Q01968	901 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	ZP2	Q05996	745 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	ITK	Q08881	620 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	GPR19	Q15760	415 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	SPRED2	Q7Z698	418 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	CNTD1	Q8N815	330 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	EMC7	Q9NPA0	242 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882		X6R8D5	127 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	SLC12A8	A0AV02	714 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	PRKD3	O94806	890 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	PRNP	P04156	253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	AMY2A	P04746	511 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	KRT15	P19012	456 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	AMY2B	P19961	511 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	EPHB1	P54762	984 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	CORO7	P57737	925 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	RTP1	P59025	263 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	C11orf74	Q86VG3	221 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	ASIC4	Q96FT7	647 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	BOC	Q9BWV1	1114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	OXSM	Q9NWU1	459 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MYCBP2-205	ENST00000474882	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	DGKI	O75912	1065 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	MSL3P1	P0C860	447 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	NEK2	P51955	445 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	MVK	Q03426	396 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	MCL1	Q07820	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	LZTR1	Q8N653	840 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	EFHB	Q8N7U6	833 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	USP33	Q8TEY7	942 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882		A0A1W2PQ27	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882		A0A1W2PQ64	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882		A0A1W2PQC6	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882		A0A1W2PQD8	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	NOTO	A8MTQ0	251 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882		H7C1D1	291 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882		K7ESF4	209 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	MAN2B1	O00754	1011 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MYCBP2-205	ENST00000474882	KCNK3	O14649	394 aa		4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms