RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468807.1

TTC28-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-204ENST00000468807 CALM2P0DP24 149 aa25.14■■□□□ 1.62
TTC28-204ENST00000468807 CALM3P0DP25 149 aa25.14■■□□□ 1.62
TTC28-204ENST00000468807 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
TTC28-204ENST00000468807 MFSD10Q14728 455 aa25.14■■□□□ 1.62
TTC28-204ENST00000468807 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
TTC28-204ENST00000468807 RNF20Q5VTR2 975 aa25.14■■□□□ 1.62
TTC28-204ENST00000468807 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
TTC28-204ENST00000468807 CCDC155Q8N6L0 562 aa25.14■■□□□ 1.62
TTC28-204ENST00000468807 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.62
TTC28-204ENST00000468807 MLXIPQ9HAP2 919 aa25.14■■□□□ 1.62
TTC28-204ENST00000468807 ACTN1P12814 892 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 RFC2P35250 354 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 RABGGTBP53611 331 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 HSDL1Q3SXM5 330 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 MYSM1Q5VVJ2 828 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 SESTD1Q86VW0 696 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 CCDC82Q8N4S0 544 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 VWCEQ96DN2 955 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 HDAC6Q9UBN7 1215 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 F2P00734 622 aa25.12■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 SMARCA1P28370 1054 aa25.12■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 LIFRP42702 1097 aa25.12■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 SP2Q02086 613 aa25.12■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 KIAA0753Q2KHM9 967 aa25.12■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 GNPTABQ3T906 1256 aa25.12■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.12■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 SLC28A3Q9HAS3 691 aa25.12■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa25.12■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa25.11■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 TGFB3P10600 412 aa25.11■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 MICU3Q86XE3 530 aa25.11■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 CAGE1Q8TC20 777 aa25.11■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 PRDM12Q9H4Q4 367 aa25.11■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
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TTC28-204ENST00000468807 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.1■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 NOP56O00567 594 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 PPFIA4O75335 1185 aa25.09■■□□□ 1.61
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TTC28-204ENST00000468807 AFAP1L1Q8TED9 768 aa25.09■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 TCEANC2Q96MN5 208 aa25.09■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 NEK1Q96PY6 1258 aa25.09■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 FRMPD4Q14CM0 1322 aa25.09■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 DOCK5Q9H7D0 1870 aa25.09■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 CHD7Q9P2D1 2997 aa25.08■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 STAM2O75886 525 aa25.08■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 MYOGP15173 224 aa25.08■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 LRRC8DQ7L1W4 858 aa25.08■■□□□ 1.61
TTC28-204ENST00000468807 TET1Q8NFU7 2136 aa25.08■■□□□ 1.61
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TTC28-204ENST00000468807 HAS3O00219 553 aa25.07■■□□□ 1.6
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TTC28-204ENST00000468807 TMTC3Q6ZXV5 915 aa25.07■■□□□ 1.6
TTC28-204ENST00000468807 CYFIP1Q7L576 1253 aa25.07■■□□□ 1.6
TTC28-204ENST00000468807 PPM1EQ8WY54 764 aa25.07■■□□□ 1.6
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TTC28-204ENST00000468807 PIK3CDO00329 1044 aa25.06■■□□□ 1.6
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TTC28-204ENST00000468807 ADCK5Q3MIX3 580 aa25.04■■□□□ 1.6
TTC28-204ENST00000468807 APOA5Q6Q788 366 aa25.04■■□□□ 1.6
TTC28-204ENST00000468807 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TTC28-204ENST00000468807 NLRX1Q86UT6 975 aa25.04■■□□□ 1.6
TTC28-204ENST00000468807 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TTC28-204ENST00000468807 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
TTC28-204ENST00000468807 KCNJ6P48051 423 aa25.03■■□□□ 1.6
TTC28-204ENST00000468807 XRRA1Q6P2D8 792 aa25.03■■□□□ 1.6
TTC28-204ENST00000468807 RASEFQ8IZ41 740 aa25.03■■□□□ 1.6
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