RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465905.5

TRAPPC10-206, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC10, Length 563 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-206ENST00000465905 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 F2P00734 622 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 ZNF286BP0CG31 522 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 HDAC6Q9UBN7 1215 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 HAS3O00219 553 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 SORBS3O60504 671 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 SELPP16109 830 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 NEDD9Q14511 834 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 VWCEQ96DN2 955 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 SLC9A7Q96T83 725 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 PIK3CDO00329 1044 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 FIBPO43427 364 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 BAIAP3O94812 1187 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 ICAM3P32942 547 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 RABGGTBP53611 331 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 SP2Q02086 613 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 RBL2Q08999 1139 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 PTK7Q13308 1070 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 PPP2R2DQ66LE6 453 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 LRRC8DQ7L1W4 858 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 NLRX1Q86UT6 975 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 KIF28PB7ZC32 967 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 RXRAP19793 462 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 KCNA4P22459 653 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 KCNJ6P48051 423 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 METTL7BQ6UX53 244 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 SGMS1Q86VZ5 419 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 FANCBQ8NB91 859 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 NEK1Q96PY6 1258 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 CTAGE1Q96RT6 745 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 LRRC2Q9BYS8 371 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 RTEL1Q9NZ71 1219 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 MEIS2O14770 477 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 CDC45O75419 566 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 CKBP12277 381 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 KRT32Q14532 448 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 MICU3Q86XE3 530 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 C16orf70Q9BSU1 422 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 USP26Q9BXU7 913 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC10-206ENST00000465905 MYO9BQ13459 2157 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 H3BRB1 525 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 LGALS2P05162 132 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 MYOGP15173 224 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 IGFBP4P22692 258 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 CNKSR3Q6P9H4 555 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 CDHR1Q96JP9 859 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 EFCAB14O75071 495 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 CXCL10P02778 98 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 GNAT1P11488 350 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 SEMA3FQ13275 785 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 SKAP1Q86WV1 359 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 HERC6Q8IVU3 1022 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAPPC10-206ENST00000465905 PPM1EQ8WY54 764 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms