RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460041.5

HOXB-AS3-202, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 728 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SEC23AQ15436 765 aa11.95□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KIAA0753Q2KHM9 967 aa11.95□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MYSM1Q5VVJ2 828 aa11.95□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRAF7Q6Q0C0 670 aa11.95□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CHST3Q7LGC8 479 aa11.95□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HLA-CQ95604 372 aa11.95□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RAD9AQ99638 391 aa11.95□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UBAC1Q9BSL1 405 aa11.95□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa11.95□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 VAT1LQ9HCJ6 419 aa11.95□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NLRC5Q86WI3 1866 aa11.95□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KLRF2D3W0D1 207 aa11.94□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZBTB5O15062 677 aa11.94□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ERVK-21P61565 698 aa11.94□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IKBKEQ14164 716 aa11.94□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KRT40Q6A162 431 aa11.94□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa11.94□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 STAG2Q8N3U4 1231 aa11.94□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZBED2Q9BTP6 218 aa11.94□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MAD2L2Q9UI95 211 aa11.94□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa11.93□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EMSYQ7Z589 1322 aa11.93□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LCHNA4D1U4 455 aa11.93□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HOXC8P31273 242 aa11.93□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DEFB103AP81534 67 aa11.93□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MBTPS1Q14703 1052 aa11.93□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PGM5Q15124 567 aa11.93□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HSDL1Q3SXM5 330 aa11.93□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF618Q5T7W0 954 aa11.93□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SERINC5Q86VE9 423 aa11.93□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ALG1Q9BT22 464 aa11.93□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RIOX1Q9H6W3 641 aa11.93□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa11.93□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 COL4A6Q14031 1691 aa11.93□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 C5orf42Q9H799 3197 aa11.92□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LGR5O75473 907 aa11.92□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 STAM2O75886 525 aa11.92□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IGHDP01880 384 aa11.92□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF286BP0CG31 522 aa11.92□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SP2Q02086 613 aa11.92□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TCTN1Q2MV58 587 aa11.92□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SPRED2Q7Z698 418 aa11.92□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 WNT8BQ93098 351 aa11.92□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SPATA33Q96N06 139 aa11.92□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 C16orf70Q9BSU1 422 aa11.92□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SUGCTQ9HAC7 445 aa11.92□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 INSL6Q9Y581 213 aa11.92□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FRMPD4Q14CM0 1322 aa11.91□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LINC01553A4QN01 128 aa11.91□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CAND2O75155 1236 aa11.91□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GGPS1O95749 300 aa11.91□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 POLR2MP0CAP2 368 aa11.91□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CCND2P30279 289 aa11.91□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRDNQ13061 729 aa11.91□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HIC1Q14526 733 aa11.91□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GRM4Q14833 912 aa11.91□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa11.91□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CYB5R4Q7L1T6 521 aa11.91□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRIOO75962 3097 aa11.91□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa11.9□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RSPH10B2B2RC85 870 aa11.9□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 H3BRB1 525 aa11.9□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RSPH10BP0C881 870 aa11.9□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ICAM3P32942 547 aa11.9□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PLA2G5P39877 138 aa11.9□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TROAPQ12815 778 aa11.9□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SLC35G1Q2M3R5 365 aa11.9□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GNPTABQ3T906 1256 aa11.9□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IL31RAQ8NI17 732 aa11.9□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GDPD5Q8WTR4 605 aa11.9□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SAMD11Q96NU1 681 aa11.9□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 USP26Q9BXU7 913 aa11.9□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IL25Q9H293 177 aa11.9□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MLXIPQ9HAP2 919 aa11.9□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MYO7AQ13402 2215 aa11.89□□□□□ -0.51
HOXB-AS3-202ENST00000460041 C17orf102A2RUQ5 167 aa11.89□□□□□ -0.51
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CYTH3O43739 400 aa11.89□□□□□ -0.51
HOXB-AS3-202ENST00000460041 AMHP03971 560 aa11.89□□□□□ -0.51
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LGALS2P05162 132 aa11.89□□□□□ -0.51
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CYP21A2P08686 494 aa11.89□□□□□ -0.51
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms