RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GAPDHP28-201ENST00000455134 MTCH2Q9Y6C9 303 aa9.79□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 C5orf42Q9H799 3197 aa9.79□□□□□ -0.84
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GAPDHP28-201ENST00000455134 PPFIA4O75335 1185 aa9.78□□□□□ -0.84
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GAPDHP28-201ENST00000455134 ACTN1P12814 892 aa9.78□□□□□ -0.84
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