RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453458.5

TNNT3-211, Transcript of troponin T3, fast skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene TNNT3, Length 699 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3-211ENST00000453458 HIC1Q14526 733 aa8.5□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 MFSD10Q14728 455 aa8.5□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 GPNMBQ14956 572 aa8.5□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 NECTIN1Q15223 517 aa8.5□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 KIAA0753Q2KHM9 967 aa8.5□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 CREB3L3Q68CJ9 461 aa8.5□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 KCNV1Q6PIU1 500 aa8.5□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 MICAL3Q7RTP6 2002 aa8.5□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 C7orf31Q8N865 590 aa8.5□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 PPM1EQ8WY54 764 aa8.5□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 SPATA33Q96N06 139 aa8.5□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 MAP3K14Q99558 947 aa8.5□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 LRRC2Q9BYS8 371 aa8.5□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 RTEL1Q9NZ71 1219 aa8.5□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.5□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 TRANK1O15050 2925 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 CCDC69A6NI79 296 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 PPFIA4O75335 1185 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 DDAH1O94760 285 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 PLEKHA8P1O95397 391 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 F2P00734 622 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 TGFB3P10600 412 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 CKBP12277 381 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 ACTN1P12814 892 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 IGFBP4P22692 258 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 RFC2P35250 354 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 ADGRE1Q14246 886 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 USP17L6PQ6QN14 398 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 NFXL1Q6ZNB6 911 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 CAGE1Q8TC20 777 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 WNT8BQ93098 351 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 TMEM87BQ96K49 555 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 C16orf70Q9BSU1 422 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 KATNAL1Q9BW62 490 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 SPZ1Q9BXG8 430 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 MLXIPQ9HAP2 919 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 ANO2Q9NQ90 1003 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 PRDM6Q9NQX0 595 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa8.49□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 SIP14410 1827 aa8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 MEIS2O14770 477 aa8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 CA3P07451 260 aa8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 SELPP16109 830 aa8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 SMARCA1P28370 1054 aa8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 KIF5BP33176 963 aa8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 LIFRP42702 1097 aa8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 SEMA3FQ13275 785 aa8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 TCTN1Q2MV58 587 aa8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 PPP2R2DQ66LE6 453 aa8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 CYFIP1Q7L576 1253 aa8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 TMTC2Q8N394 836 aa8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 AFAP1L1Q8TED9 768 aa8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 MTA3Q9BTC8 594 aa8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 CERS4Q9HA82 394 aa8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 TELO2Q9Y4R8 837 aa8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 NLRC5Q86WI3 1866 aa8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 FRMPD4Q14CM0 1322 aa8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 XIRP2A4UGR9 3374 aa8.48□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 WDR81Q562E7 1941 aa8.47□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.47□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 H3BRB1 525 aa8.47□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 RFXAPO00287 272 aa8.47□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 PIK3CDO00329 1044 aa8.47□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 NBNO60934 754 aa8.47□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 STAM2O75886 525 aa8.47□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 ARHGEF15O94989 841 aa8.47□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 ICAM3P32942 547 aa8.47□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 GNAQP50148 359 aa8.47□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 RBL2Q08999 1139 aa8.47□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 PTK7Q13308 1070 aa8.47□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 GNPTABQ3T906 1256 aa8.47□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.47□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.47□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 LRRC8DQ7L1W4 858 aa8.47□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 HERC6Q8IVU3 1022 aa8.47□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 FANCBQ8NB91 859 aa8.47□□□□□ -1.05
TNNT3-211ENST00000453458 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms