RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-210	ENST00000440825	NOD1	Q9Y239	953 aa		31.86	■■■□□ 2.69
FAAP20-210	ENST00000440825	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		31.85	■■■□□ 2.69
FAAP20-210	ENST00000440825	STAM2	O75886	525 aa		31.85	■■■□□ 2.69
FAAP20-210	ENST00000440825	TGFB3	P10600	412 aa		31.85	■■■□□ 2.69
FAAP20-210	ENST00000440825	RCAN1	P53805	252 aa		31.85	■■■□□ 2.69
FAAP20-210	ENST00000440825	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		31.85	■■■□□ 2.69
FAAP20-210	ENST00000440825		Q7L0L9	218 aa		31.85	■■■□□ 2.69
FAAP20-210	ENST00000440825	ALG1	Q9BT22	464 aa		31.85	■■■□□ 2.69
FAAP20-210	ENST00000440825	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		31.84	■■■□□ 2.69
FAAP20-210	ENST00000440825	DEFB123	Q8N688	67 aa		31.84	■■■□□ 2.69
FAAP20-210	ENST00000440825	KAT2B	Q92831	832 aa		31.84	■■■□□ 2.69
FAAP20-210	ENST00000440825	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
FAAP20-210	ENST00000440825	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	31.84	■■■□□ 2.69	4e-10	■■□□□ 12.1
FAAP20-210	ENST00000440825	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
FAAP20-210	ENST00000440825	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
FAAP20-210	ENST00000440825	RUFY3	Q7L099	469 aa		31.83	■■■□□ 2.69
FAAP20-210	ENST00000440825	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		31.83	■■■□□ 2.69
FAAP20-210	ENST00000440825	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		31.83	■■■□□ 2.69
FAAP20-210	ENST00000440825	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		31.83	■■■□□ 2.69
FAAP20-210	ENST00000440825	FIBP	O43427	364 aa		31.82	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	PSEN2	P49810	448 aa		31.82	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		31.82	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		31.82	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	STXBP3	O00186	592 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	PPFIA3	O75145	1194 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	ADCY7	P51828	1080 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	SP4	Q02446	784 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	NLRX1	Q86UT6	975 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	SCLY	Q96I15	445 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	ICAM3	P32942	547 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	SEMA3F	Q13275	785 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	NEDD9	Q14511	834 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	MFSD10	Q14728	455 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	PTGIS	Q16647	500 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	TMEM240	Q5SV17	173 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	GPR153	Q6NV75	609 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	C7orf31	Q8N865	590 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	PGBD1	Q96JS3	809 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	IL23A	Q9NPF7	189 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	BARHL2	Q9NY43	387 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	SMCO2	A6NFE2	343 aa		31.79	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		31.79	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	ZNF365	Q70YC5	407 aa		31.79	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		31.79	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		31.78	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	PPFIA4	O75335	1185 aa		31.78	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	FBXL16	Q8N461	479 aa		31.78	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	PHKB	Q93100	1093 aa		31.78	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		31.78	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		31.78	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		31.78	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	F2	P00734	622 aa		31.77	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	SCG2	P13521	617 aa		31.77	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	METTL7B	Q6UX53	244 aa		31.77	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	FAM161B	Q96MY7	647 aa		31.77	■■■□□ 2.68
FAAP20-210	ENST00000440825	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
FAAP20-210	ENST00000440825	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
FAAP20-210	ENST00000440825	RETREG2	Q8NC44	543 aa		31.76	■■■□□ 2.67
FAAP20-210	ENST00000440825	TMEM260	Q9NX78	707 aa		31.76	■■■□□ 2.67
FAAP20-210	ENST00000440825	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
FAAP20-210	ENST00000440825	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		31.75	■■■□□ 2.67
FAAP20-210	ENST00000440825	GPRASP2	Q96D09	838 aa		31.75	■■■□□ 2.67
FAAP20-210	ENST00000440825	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		31.75	■■■□□ 2.67
FAAP20-210	ENST00000440825	NID2	Q14112	1375 aa		31.74	■■■□□ 2.67
FAAP20-210	ENST00000440825	FGB	P02675	491 aa		31.74	■■■□□ 2.67
FAAP20-210	ENST00000440825	ITGB5	P18084	799 aa		31.74	■■■□□ 2.67
FAAP20-210	ENST00000440825	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
FAAP20-210	ENST00000440825	MTMR1	Q13613	665 aa		31.74	■■■□□ 2.67
FAAP20-210	ENST00000440825	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		31.74	■■■□□ 2.67
FAAP20-210	ENST00000440825	SESTD1	Q86VW0	696 aa		31.74	■■■□□ 2.67
FAAP20-210	ENST00000440825	ANO3	Q9BYT9	981 aa		31.74	■■■□□ 2.67
FAAP20-210	ENST00000440825	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		31.74	■■■□□ 2.67
FAAP20-210	ENST00000440825	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		31.74	■■■□□ 2.67
FAAP20-210	ENST00000440825	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		31.74	■■■□□ 2.67
FAAP20-210	ENST00000440825	LGALS2	P05162	132 aa		31.73	■■■□□ 2.67
FAAP20-210	ENST00000440825	BFSP2	Q13515	415 aa		31.73	■■■□□ 2.67
FAAP20-210	ENST00000440825	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
FAAP20-210	ENST00000440825	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		31.73	■■■□□ 2.67
FAAP20-210	ENST00000440825	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms