RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436287.1

ACTBP11-201, Transcript of actin, beta pseudogene 11, humanhuman

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Gene ACTBP11, Length 1,126 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP11-201ENST00000436287 MYSM1Q5VVJ2 828 aa17.4■□□□□ 0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP17.4■□□□□ 0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM178BQ8IXR5 827 aa17.4■□□□□ 0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 GJD3Q8N144 294 aa17.4■□□□□ 0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 DBF4BQ8NFT6 615 aa17.4■□□□□ 0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 VAT1LQ9HCJ6 419 aa17.4■□□□□ 0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 MUC6Q6W4X9 2439 aa17.4■□□□□ 0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 EMSYQ7Z589 1322 aa17.4■□□□□ 0.38
ACTBP11-201ENST00000436287 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
ACTBP11-201ENST00000436287 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa17.39■□□□□ 0.37
ACTBP11-201ENST00000436287 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa17.39■□□□□ 0.37
ACTBP11-201ENST00000436287 OPLAHO14841 1288 aa17.39■□□□□ 0.37
ACTBP11-201ENST00000436287 RGS20O76081 388 aa17.39■□□□□ 0.37
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ACTBP11-201ENST00000436287 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
ACTBP11-201ENST00000436287 KCNA5P22460 613 aa17.39■□□□□ 0.37
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ACTBP11-201ENST00000436287 RSPH10B2B2RC85 870 aa17.38■□□□□ 0.37
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ACTBP11-201ENST00000436287 RSPH10BP0C881 870 aa17.38■□□□□ 0.37
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ACTBP11-201ENST00000436287 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
ACTBP11-201ENST00000436287 HSDL1Q3SXM5 330 aa17.38■□□□□ 0.37
ACTBP11-201ENST00000436287 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
ACTBP11-201ENST00000436287 KCNV1Q6PIU1 500 aa17.38■□□□□ 0.37
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ACTBP11-201ENST00000436287 SERINC5Q86VE9 423 aa17.38■□□□□ 0.37
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ACTBP11-201ENST00000436287 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
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ACTBP11-201ENST00000436287 PDCD2LQ9BRP1 358 aa17.38■□□□□ 0.37
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ACTBP11-201ENST00000436287 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
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ACTBP11-201ENST00000436287 B4E1Z4 1266 aa17.37■□□□□ 0.37
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ACTBP11-201ENST00000436287 IL9P15248 144 aa17.35■□□□□ 0.37
ACTBP11-201ENST00000436287 HOXC8P31273 242 aa17.35■□□□□ 0.37
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ACTBP11-201ENST00000436287 STAG2Q8N3U4 1231 aa17.35■□□□□ 0.37
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ACTBP11-201ENST00000436287 TOP1MTQ969P6 601 aa17.35■□□□□ 0.37
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ACTBP11-201ENST00000436287 C17orf102A2RUQ5 167 aa17.34■□□□□ 0.37
ACTBP11-201ENST00000436287 KLRF2D3W0D1 207 aa17.34■□□□□ 0.37
ACTBP11-201ENST00000436287 H3BRB1 525 aa17.34■□□□□ 0.37
ACTBP11-201ENST00000436287 ZBTB5O15062 677 aa17.34■□□□□ 0.37
ACTBP11-201ENST00000436287 SORBS3O60504 671 aa17.34■□□□□ 0.37
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ACTBP11-201ENST00000436287 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
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ACTBP11-201ENST00000436287 IL31RAQ8NI17 732 aa17.34■□□□□ 0.37
ACTBP11-201ENST00000436287 SEPT8Q92599 483 aa17.34■□□□□ 0.37
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ACTBP11-201ENST00000436287 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa17.34■□□□□ 0.37
ACTBP11-201ENST00000436287 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.37
ACTBP11-201ENST00000436287 H3BNC9 293 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTBP11-201ENST00000436287 RRP1P56182 461 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
ACTBP11-201ENST00000436287 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
ACTBP11-201ENST00000436287 TIGD5Q53EQ6 642 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTBP11-201ENST00000436287 BANK1Q8NDB2 785 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTBP11-201ENST00000436287 YME1L1Q96TA2 773 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTBP11-201ENST00000436287 UBAC1Q9BSL1 405 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTBP11-201ENST00000436287 DSCC1Q9BVC3 393 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTBP11-201ENST00000436287 OSBPL7Q9BZF2 842 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTBP11-201ENST00000436287 KRT23Q9C075 422 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTBP11-201ENST00000436287 RNPEPQ9H4A4 650 aa17.33■□□□□ 0.36
ACTBP11-201ENST00000436287 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
ACTBP11-201ENST00000436287 H3BQ06 376 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
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