RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MTHFRP42898 656 aa10.52□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CES5AQ6NT32 575 aa10.52□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RASGRP4Q8TDF6 673 aa10.52□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TEX13BQ9BXU2 312 aa10.52□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADAM7Q9H2U9 754 aa10.52□□□□□ -0.72
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ITPR3Q14573 2671 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SHROOM3Q8TF72 1996 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GREB1Q4ZG55 1949 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C2CD3Q4AC94 2353 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KPNA6O60684 536 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PHKA1P46020 1223 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ITIH3Q06033 890 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SRPK3Q9UPE1 567 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MYH1P12882 1939 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GRM8O00222 908 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CFHP08603 1231 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RIPPLY3P57055 190 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DUSP28Q4G0W2 176 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF618Q5T7W0 954 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C8orf58Q8NAV2 365 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PJA1Q8NG27 643 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCNK4Q9NYG8 393 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RIPK3Q9Y572 518 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ASB14A6NK59 587 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EOMESO95936 686 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF853P0CG23 659 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TROAPQ12815 778 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SEPT2Q15019 361 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TPRNQ4KMQ1 711 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CA14Q9ULX7 337 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NARSO43776 548 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCR10P46092 362 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ANKRD35Q8N283 1001 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KLHL23Q8NBE8 558 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STK31Q9BXU1 1019 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCNK12Q9HB15 430 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FBXO28Q9NVF7 368 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NAV1Q8NEY1 1877 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 E9PSI1 815 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RASGRF1Q13972 1273 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LPAL2Q16609 132 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC39A7Q92504 469 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SEPT8Q92599 483 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KAZALD1Q96I82 304 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EHD4Q9H223 541 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MSRB2Q9Y3D2 182 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLCG2P16885 1265 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTK7Q13308 1070 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPICE1Q8N0Z3 855 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SERPINB13Q9UIV8 391 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CNTN2Q02246 1040 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STPG1Q5TH74 334 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 VCPKMTQ9H867 229 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGSF9Q9P2J2 1179 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MYH7BA7E2Y1 1941 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP17L12C9JPN9 530 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP17L21D6R901 530 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UBE3AQ05086 875 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FLIIQ13045 1269 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BEND3Q5T5X7 828 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIAA1841Q6NSI8 718 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 XRRA1Q6P2D8 792 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC4A10Q6U841 1118 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRIG1Q96JA1 1093 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BCO2Q9BYV7 579 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 VTA1Q9NP79 307 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FBXO40Q9UH90 709 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRRN2O75325 713 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPP4CP60510 307 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RUFY4Q6ZNE9 571 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF843Q8N446 348 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR6J1Q8NGC5 347 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CASP10Q92851 521 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SUCLG2Q96I99 432 aa10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms