RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425333.5

PCBP1-AS1-222, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCBP1-AS1, Length 546 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 ECHDC1Q9NTX5 307 aa6.07□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 MTUS1Q9ULD2 1270 aa6.07□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CCPG1Q9ULG6 757 aa6.07□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.07□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 TRPC6Q9Y210 931 aa6.07□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 SIP14410 1827 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 NFIBO00712 420 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 ICAM1P05362 532 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 IL9P15248 144 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 GNAT2P19087 354 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CALML3P27482 149 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 WDR5P61964 334 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 DEFB103AP81534 67 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 PDE4BQ07343 736 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 PPARAQ07869 468 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 BFSP2Q13515 415 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 PTGISQ16647 500 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 NFRKBQ6P4R8 1299 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CTAGE1Q96RT6 745 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 LRRCC1Q9C099 1032 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 STX8Q9UNK0 236 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 PLIN4Q96Q06 1357 aa6.06□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 LINC01553A4QN01 128 aa6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 TSPY2A6NKD2 308 aa6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 PRR33A8MZF0 331 aa6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 MARCH6O60337 910 aa6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 KPNA6O60684 536 aa6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 NBNO60934 754 aa6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 BAIAP3O94812 1187 aa6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 ARIH2O95376 493 aa6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 RECKO95980 971 aa6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 TXNP10599 105 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 KCNA5P22460 613 aa6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 KCNJ6P48051 423 aa6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 ERVK-21P61565 698 aa6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CCDC96Q2M329 555 aa6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 LEXMQ3ZCV2 418 aa6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 SLC30A10Q6XR72 485 aa6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 GJD3Q8N144 294 aa6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 TBC1D5Q92609 795 aa6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 ANKS1AQ92625 1134 aa6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 UIMC1Q96RL1 719 aa6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 NAPBQ9H115 298 aa6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 DDX19BQ9UMR2 479 aa6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 NOD1Q9Y239 953 aa6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 C5orf42Q9H799 3197 aa6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 RCCD1A6NED2 376 aa6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 FOXP2O15409 715 aa6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 GJB5O95377 273 aa6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CKBP12277 381 aa6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 SELPP16109 830 aa6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 NOVP48745 357 aa6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 MRE11P49959 708 aa6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 RPS6P62753 249 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 PPP2R5BQ15173 497 aa6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 LY6KQ17RY6 165 aa6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 LRRC8DQ7L1W4 858 aa6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 CHST3Q7LGC8 479 aa6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 AFAP1L1Q8TED9 768 aa6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 SCFD2Q8WU76 684 aa6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 DCAF4Q8WV16 495 aa6.04□□□□□ -1.44
PCBP1-AS1-222ENST00000425333 AFG1LQ8WV93 481 aa6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms