RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZSWIM5Q9P217 1185 aa15.34■□□□□ 0.05
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTNNA3Q9UI47 895 aa15.32■□□□□ 0.04
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PGM5Q15124 567 aa15.31■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSDL1Q3SXM5 330 aa15.31■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYSM1Q5VVJ2 828 aa15.31■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNV1Q6PIU1 500 aa15.31■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STOX1Q6ZVD7 989 aa15.31■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPATA33Q96N06 139 aa15.31■□□□□ 0.04
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLRF2D3W0D1 207 aa15.3■□□□□ 0.04
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SORBS3O60504 671 aa15.3■□□□□ 0.04
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM117BQ6P1L5 589 aa15.3■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL31RAQ8NI17 732 aa15.3■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAD2L2Q9UI95 211 aa15.3■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa15.3■□□□□ 0.04
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EMSYQ7Z589 1322 aa15.3■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa15.29■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VSIG10LQ86VR7 867 aa15.29■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAMD3Q8N6K7 520 aa15.29■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPHX3Q9H6B9 360 aa15.29■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCND2P30279 289 aa15.28■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SP2Q02086 613 aa15.28■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP15.28■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERINC5Q86VE9 423 aa15.28■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOMER1Q86YM7 354 aa15.28■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM122AQ96E09 287 aa15.28■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C16orf70Q9BSU1 422 aa15.28■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL25Q9H293 177 aa15.28■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C17orf102A2RUQ5 167 aa15.27■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RSPH10B2B2RC85 870 aa15.27■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHDP01880 384 aa15.27■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AMHP03971 560 aa15.27■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RSPH10BP0C881 870 aa15.27■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLR2MP0CAP2 368 aa15.27■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TGFB3P10600 412 aa15.27■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THPOP40225 353 aa15.27■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC35G1Q2M3R5 365 aa15.27■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYB5R4Q7L1T6 521 aa15.27■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYOCDQ8IZQ8 938 aa15.27■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DBF4BQ8NFT6 615 aa15.27■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP15.27■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRFN3Q9BTN0 628 aa15.27■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MLXIPQ9HAP2 919 aa15.27■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INSL6Q9Y581 213 aa15.27■□□□□ 0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOXC8P31273 242 aa15.27■□□□□ 0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAF1Q13077 416 aa15.27■□□□□ 0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRM4Q14833 912 aa15.27■□□□□ 0.03
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
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