RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403915.5

KCNS3-202, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS3, Length 2,397 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3-202ENST00000403915 USH1CQ9Y6N9 552 aa10.15□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 PHLPP1O60346 1717 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 PRC1O43663 620 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 PCK1P35558 622 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 TNNI2P48788 182 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 MXI1P50539 228 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 HPCAP84074 193 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 PTGISQ16647 500 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 ARL13BQ3SXY8 428 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 NEK5Q6P3R8 708 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 C1orf228Q6PIY5 440 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 LVRNQ6Q4G3 990 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 BARGINQ6ZT62 677 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 CCDC83Q8IWF9 413 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 PTPRN2Q92932 1015 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 GIMAP5Q96F15 307 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 WDR24Q96S15 920 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 PSTPIP2Q9H939 334 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 ATPIF1Q9UII2 106 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 ADAMTS8Q9UP79 889 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 TNNQ9UQP3 1299 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 RGS12O14924 1447 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 ARHGAP5Q13017 1502 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 MYO5CQ9NQX4 1742 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 AGPSO00116 658 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 ACSL4O60488 711 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 SERPINB7O75635 380 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 ASLP04424 464 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 HOXC13P31276 330 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 CCNFP41002 786 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 ADARP55265 1226 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 DSTNP60981 165 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 STK11Q15831 433 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 CAMK4Q16566 473 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 MAEAQ7L5Y9 396 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 RASGRP2Q7LDG7 609 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 HELQQ8TDG4 1101 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 DPF3Q92784 378 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 NSMCE3Q96MG7 304 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 CCT8L2Q96SF2 557 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 SLF1Q9BQI6 1058 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 DNAJC25Q9H1X3 360 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 NDST4Q9H3R1 872 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 ZHX3Q9H4I2 956 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 TRPC7Q9HCX4 862 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 PANK4Q9NVE7 773 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 ETNK2Q9NVF9 386 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 HYPKQ9NX55 129 aa10.14□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 PREX2Q70Z35 1606 aa10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 GOLGA8IPA6NC78 632 aa10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 RTL1A6NKG5 1358 aa10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 NOTOA8MTQ0 251 aa10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 KIF28PB7ZC32 967 aa10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 ALADP13716 330 aa10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 LSP1P33241 339 aa10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 BASP1P80723 227 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 KIF22Q14807 665 aa10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 ARMCX5Q6P1M9 558 aa10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 KLC3Q6P597 504 aa10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 NT5DC4Q86YG4 428 aa10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 COG1Q8WTW3 980 aa10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 BEGAINQ9BUH8 593 aa10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 CCDC87Q9NVE4 849 aa10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 TBCCD1Q9NVR7 557 aa10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 CABP1Q9NZU7 370 aa10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 HDAC9Q9UKV0 1011 aa10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 MKL2Q9ULH7 1088 aa10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 E9PCH4 1651 aa10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 GOLGA8KD6RF30 607 aa10.12□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 M0QX08 132 aa10.12□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 HOXA2O43364 376 aa10.12□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 SPATA31D3P0C874 917 aa10.12□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 UBASH3AP57075 661 aa10.12□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 NLRP12P59046 1061 aa10.12□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 TOMM20Q15388 145 aa10.12□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 SH3D19Q5HYK7 790 aa10.12□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 SIGIRRQ6IA17 410 aa10.12□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa10.12□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 ZNF449Q6P9G9 518 aa10.12□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 CCDC81Q6ZN84 652 aa10.12□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa10.12□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 NLRP14Q86W24 1093 aa10.12□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 RASEFQ8IZ41 740 aa10.12□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 ABTB2Q8N961 1025 aa10.12□□□□□ -0.79
KCNS3-202ENST00000403915 FAM133AQ8N9E0 248 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms