RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.84■■□□□ 1.25
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HDDC3-202ENST00000394272 ARP10275 920 aa22.83■■□□□ 1.25
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HDDC3-202ENST00000394272 CCL15Q16663 113 aa22.83■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 UVSSAQ2YD98 709 aa22.83■■□□□ 1.25
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.83■■□□□ 1.25
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HDDC3-202ENST00000394272 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.82■■□□□ 1.24
HDDC3-202ENST00000394272 STK17AQ9UEE5 414 aa22.82■■□□□ 1.24
HDDC3-202ENST00000394272 SLC25A27O95847 323 aa22.81■■□□□ 1.24
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HDDC3-202ENST00000394272 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.81■■□□□ 1.24
HDDC3-202ENST00000394272 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.81■■□□□ 1.24
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HDDC3-202ENST00000394272 PASKQ96RG2 1323 aa22.81■■□□□ 1.24
HDDC3-202ENST00000394272 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.81■■□□□ 1.24
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HDDC3-202ENST00000394272 ISM2Q6H9L7 571 aa22.81■■□□□ 1.24
HDDC3-202ENST00000394272 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.81■■□□□ 1.24
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HDDC3-202ENST00000394272 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.81■■□□□ 1.24
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HDDC3-202ENST00000394272 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.8■■□□□ 1.24
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HDDC3-202ENST00000394272 ERMNQ8TAM6 284 aa22.79■■□□□ 1.24
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HDDC3-202ENST00000394272 GAS7O60861 476 aa22.78■■□□□ 1.24
HDDC3-202ENST00000394272 MED24O75448 989 aa22.78■■□□□ 1.24
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HDDC3-202ENST00000394272 MTMR1Q13613 665 aa22.78■■□□□ 1.24
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HDDC3-202ENST00000394272 POTEBQ6S5H4 581 aa22.77■■□□□ 1.24
HDDC3-202ENST00000394272 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.77■■□□□ 1.24
HDDC3-202ENST00000394272 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HDDC3-202ENST00000394272 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.77■■□□□ 1.24
HDDC3-202ENST00000394272 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
HDDC3-202ENST00000394272 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HDDC3-202ENST00000394272 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
HDDC3-202ENST00000394272 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HDDC3-202ENST00000394272 CNTN2Q02246 1040 aa22.77■■□□□ 1.24
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