RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393503.2

CNGA3-202, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene CNGA3, Length 569 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-202ENST00000393503 CCDC178Q5BJE1 867 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 MYSM1Q5VVJ2 828 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 PPTC7Q8NI37 304 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 CAGE1Q8TC20 777 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 NOD1Q9Y239 953 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 MRVI1Q9Y6F6 885 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 B4DLN1 442 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 ZBTB5O15062 677 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 BAIAP3O94812 1187 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 CYP21A2P08686 494 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 CASTP20810 708 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 AAMPQ13685 434 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 PGM5Q15124 567 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF618Q5T7W0 954 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 VSIG10LQ86VR7 867 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 PIGSQ96S52 555 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 UBAC1Q9BSL1 405 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 C16orf70Q9BSU1 422 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 AMNQ9BXJ7 453 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 KRT23Q9C075 422 aa15.47■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 COL9A1P20849 921 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 NT5C2P49902 561 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 ANTXR2P58335 489 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 SEMA3FQ13275 785 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 GRM4Q14833 912 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 GDPD5Q8WTR4 605 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 RIOX1Q9H6W3 641 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-202ENST00000393503 MYH7BA7E2Y1 1941 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 HIP1O00291 1037 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 TLL1O43897 1013 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 GGPS1O95749 300 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 HOXC8P31273 242 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 TROAPQ12815 778 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 PTK7Q13308 1070 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 LAMC2Q13753 1193 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 TTC22Q5TAA0 569 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 CNKSR3Q6P9H4 555 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 HOMER1Q86YM7 354 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 C7orf31Q8N865 590 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 CNNM2Q9H8M5 875 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 CTNNA3Q9UI47 895 aa15.45■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 GJB5O95377 273 aa15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 SPATA33Q96N06 139 aa15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 SUGCTQ9HAC7 445 aa15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 MTUS1Q9ULD2 1270 aa15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 FRMPD4Q14CM0 1322 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 LINC01553A4QN01 128 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 CHMLP26374 656 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 FAM117BQ6P1L5 589 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 SERINC5Q86VE9 423 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 FCHSD1Q86WN1 690 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 CCDC155Q8N6L0 562 aa15.43■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 PPFIA4O75335 1185 aa15.42■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 KCNJ6P48051 423 aa15.42■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 TRIM50Q86XT4 487 aa15.42■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 DBF4BQ8NFT6 615 aa15.42■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 CD320Q9NPF0 282 aa15.42■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa15.41■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 KIF28PB7ZC32 967 aa15.41■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 E7EWF7 191 aa15.41■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 TREHO43280 583 aa15.41■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 LGR5O75473 907 aa15.41■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 LGALS2P05162 132 aa15.41■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 POLR2MP0CAP2 368 aa15.41■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa15.41■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa15.41■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 ERVK-21P61565 698 aa15.41■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa15.41■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 PIBF1Q8WXW3 757 aa15.41■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 RAD9AQ99638 391 aa15.41■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 C17orf80Q9BSJ5 609 aa15.41■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 MYL10Q9BUA6 226 aa15.41■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 KATNAL1Q9BW62 490 aa15.41■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 EPHX3Q9H6B9 360 aa15.41■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 DOCK5Q9H7D0 1870 aa15.41■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa15.4■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 CCND2P30279 289 aa15.4■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 THPOP40225 353 aa15.4■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 RNPEPQ9H4A4 650 aa15.4■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 RTEL1Q9NZ71 1219 aa15.4■□□□□ 0.06
CNGA3-202ENST00000393503 MICAL3Q7RTP6 2002 aa15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms